Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S4

Ccdc186, Coiled-coil domain-containing protein 186, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc186Q8C9S4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Ccdc186Q8C9S4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Ccdc186Q8C9S4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Ccdc186Q8C9S4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Ccdc186Q8C9S4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Ccdc186Q8C9S4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Ccdc186Q8C9S4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26,37■■□□□ 1,81
Ccdc186Q8C9S4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26,34■■□□□ 1,81
Ccdc186Q8C9S4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,8
Ccdc186Q8C9S4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Ccdc186Q8C9S4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Ccdc186Q8C9S4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Ccdc186Q8C9S4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Ccdc186Q8C9S4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Ccdc186Q8C9S4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Ccdc186Q8C9S4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Ccdc186Q8C9S4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Ccdc186Q8C9S4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Ccdc186Q8C9S4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Ccdc186Q8C9S4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Ccdc186Q8C9S4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Ccdc186Q8C9S4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26,28■■□□□ 1,8
Ccdc186Q8C9S4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,27■■□□□ 1,8
Ccdc186Q8C9S4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Ccdc186Q8C9S4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Ccdc186Q8C9S4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Ccdc186Q8C9S4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Ccdc186Q8C9S4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Ccdc186Q8C9S4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Ccdc186Q8C9S4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Ccdc186Q8C9S4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Ccdc186Q8C9S4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Ccdc186Q8C9S4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Ccdc186Q8C9S4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Ccdc186Q8C9S4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,2■■□□□ 1,78
Ccdc186Q8C9S4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Ccdc186Q8C9S4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Ccdc186Q8C9S4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Ccdc186Q8C9S4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Ccdc186Q8C9S4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Ccdc186Q8C9S4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Ccdc186Q8C9S4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Ccdc186Q8C9S4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Ccdc186Q8C9S4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,11■■□□□ 1,77
Ccdc186Q8C9S4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Ccdc186Q8C9S4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26,11■■□□□ 1,77
Ccdc186Q8C9S4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Ccdc186Q8C9S4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Ccdc186Q8C9S4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Ccdc186Q8C9S4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Ccdc186Q8C9S4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Ccdc186Q8C9S4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Ccdc186Q8C9S4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,08■■□□□ 1,76
Ccdc186Q8C9S4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Ccdc186Q8C9S4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Ccdc186Q8C9S4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Ccdc186Q8C9S4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Ccdc186Q8C9S4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Ccdc186Q8C9S4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Ccdc186Q8C9S4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26■■□□□ 1,75
Ccdc186Q8C9S4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Ccdc186Q8C9S4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Ccdc186Q8C9S4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25,99■■□□□ 1,75
Ccdc186Q8C9S4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Ccdc186Q8C9S4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Ccdc186Q8C9S4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Ccdc186Q8C9S4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Ccdc186Q8C9S4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Ccdc186Q8C9S4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Ccdc186Q8C9S4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Ccdc186Q8C9S4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Ccdc186Q8C9S4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Ccdc186Q8C9S4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25,93■■□□□ 1,74
Ccdc186Q8C9S4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Ccdc186Q8C9S4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Ccdc186Q8C9S4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Ccdc186Q8C9S4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Ccdc186Q8C9S4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Ccdc186Q8C9S4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
Ccdc186Q8C9S4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Ccdc186Q8C9S4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Ccdc186Q8C9S4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25,88■■□□□ 1,73
Ccdc186Q8C9S4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Ccdc186Q8C9S4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Ccdc186Q8C9S4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Ccdc186Q8C9S4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Ccdc186Q8C9S4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Ccdc186Q8C9S4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Ccdc186Q8C9S4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Ccdc186Q8C9S4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25,84■■□□□ 1,73
Ccdc186Q8C9S4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Ccdc186Q8C9S4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Ccdc186Q8C9S4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Ccdc186Q8C9S4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Ccdc186Q8C9S4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Ccdc186Q8C9S4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Ccdc186Q8C9S4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Ccdc186Q8C9S4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Ccdc186Q8C9S4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Ccdc186Q8C9S4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,5 ms