Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9L1

BC106179, BC106179 protein, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC106179Q8C9L1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BC106179Q8C9L1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BC106179Q8C9L1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BC106179Q8C9L1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BC106179Q8C9L1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BC106179Q8C9L1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BC106179Q8C9L1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BC106179Q8C9L1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BC106179Q8C9L1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BC106179Q8C9L1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BC106179Q8C9L1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BC106179Q8C9L1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BC106179Q8C9L1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BC106179Q8C9L1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BC106179Q8C9L1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BC106179Q8C9L1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BC106179Q8C9L1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BC106179Q8C9L1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BC106179Q8C9L1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BC106179Q8C9L1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BC106179Q8C9L1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BC106179Q8C9L1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BC106179Q8C9L1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BC106179Q8C9L1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BC106179Q8C9L1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BC106179Q8C9L1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BC106179Q8C9L1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BC106179Q8C9L1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BC106179Q8C9L1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BC106179Q8C9L1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BC106179Q8C9L1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BC106179Q8C9L1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BC106179Q8C9L1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BC106179Q8C9L1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BC106179Q8C9L1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BC106179Q8C9L1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BC106179Q8C9L1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC106179Q8C9L1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC106179Q8C9L1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC106179Q8C9L1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BC106179Q8C9L1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BC106179Q8C9L1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC106179Q8C9L1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC106179Q8C9L1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC106179Q8C9L1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BC106179Q8C9L1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BC106179Q8C9L1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BC106179Q8C9L1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BC106179Q8C9L1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BC106179Q8C9L1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC106179Q8C9L1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC106179Q8C9L1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC106179Q8C9L1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC106179Q8C9L1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC106179Q8C9L1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC106179Q8C9L1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC106179Q8C9L1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC106179Q8C9L1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC106179Q8C9L1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC106179Q8C9L1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC106179Q8C9L1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC106179Q8C9L1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BC106179Q8C9L1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC106179Q8C9L1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC106179Q8C9L1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC106179Q8C9L1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC106179Q8C9L1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC106179Q8C9L1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC106179Q8C9L1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC106179Q8C9L1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC106179Q8C9L1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC106179Q8C9L1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC106179Q8C9L1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC106179Q8C9L1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC106179Q8C9L1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC106179Q8C9L1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC106179Q8C9L1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC106179Q8C9L1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC106179Q8C9L1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC106179Q8C9L1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC106179Q8C9L1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC106179Q8C9L1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC106179Q8C9L1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC106179Q8C9L1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC106179Q8C9L1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC106179Q8C9L1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC106179Q8C9L1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC106179Q8C9L1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC106179Q8C9L1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC106179Q8C9L1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC106179Q8C9L1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BC106179Q8C9L1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BC106179Q8C9L1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BC106179Q8C9L1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BC106179Q8C9L1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BC106179Q8C9L1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BC106179Q8C9L1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BC106179Q8C9L1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BC106179Q8C9L1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BC106179Q8C9L1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms