Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwc2Q8C8N3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwc2Q8C8N3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwc2Q8C8N3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwc2Q8C8N3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vwc2Q8C8N3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vwc2Q8C8N3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vwc2Q8C8N3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vwc2Q8C8N3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vwc2Q8C8N3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vwc2Q8C8N3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vwc2Q8C8N3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vwc2Q8C8N3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwc2Q8C8N3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwc2Q8C8N3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwc2Q8C8N3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwc2Q8C8N3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwc2Q8C8N3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwc2Q8C8N3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwc2Q8C8N3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwc2Q8C8N3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwc2Q8C8N3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwc2Q8C8N3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vwc2Q8C8N3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Vwc2Q8C8N3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vwc2Q8C8N3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vwc2Q8C8N3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vwc2Q8C8N3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vwc2Q8C8N3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vwc2Q8C8N3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vwc2Q8C8N3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vwc2Q8C8N3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vwc2Q8C8N3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vwc2Q8C8N3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vwc2Q8C8N3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vwc2Q8C8N3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vwc2Q8C8N3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwc2Q8C8N3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwc2Q8C8N3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vwc2Q8C8N3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vwc2Q8C8N3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vwc2Q8C8N3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vwc2Q8C8N3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vwc2Q8C8N3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vwc2Q8C8N3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vwc2Q8C8N3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vwc2Q8C8N3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vwc2Q8C8N3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vwc2Q8C8N3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vwc2Q8C8N3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vwc2Q8C8N3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vwc2Q8C8N3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vwc2Q8C8N3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vwc2Q8C8N3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vwc2Q8C8N3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vwc2Q8C8N3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vwc2Q8C8N3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vwc2Q8C8N3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vwc2Q8C8N3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vwc2Q8C8N3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vwc2Q8C8N3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vwc2Q8C8N3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vwc2Q8C8N3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vwc2Q8C8N3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vwc2Q8C8N3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwc2Q8C8N3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwc2Q8C8N3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vwc2Q8C8N3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vwc2Q8C8N3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vwc2Q8C8N3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vwc2Q8C8N3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vwc2Q8C8N3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vwc2Q8C8N3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vwc2Q8C8N3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vwc2Q8C8N3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwc2Q8C8N3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwc2Q8C8N3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwc2Q8C8N3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwc2Q8C8N3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vwc2Q8C8N3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwc2Q8C8N3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwc2Q8C8N3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vwc2Q8C8N3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vwc2Q8C8N3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vwc2Q8C8N3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vwc2Q8C8N3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vwc2Q8C8N3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vwc2Q8C8N3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vwc2Q8C8N3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vwc2Q8C8N3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vwc2Q8C8N3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwc2Q8C8N3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vwc2Q8C8N3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vwc2Q8C8N3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vwc2Q8C8N3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwc2Q8C8N3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwc2Q8C8N3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwc2Q8C8N3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwc2Q8C8N3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwc2Q8C8N3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms