Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K6

Atxn7l2, Ataxin 7-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l2Q8C8K6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atxn7l2Q8C8K6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atxn7l2Q8C8K6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atxn7l2Q8C8K6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Atxn7l2Q8C8K6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atxn7l2Q8C8K6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atxn7l2Q8C8K6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atxn7l2Q8C8K6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atxn7l2Q8C8K6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atxn7l2Q8C8K6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Atxn7l2Q8C8K6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atxn7l2Q8C8K6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atxn7l2Q8C8K6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atxn7l2Q8C8K6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atxn7l2Q8C8K6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atxn7l2Q8C8K6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atxn7l2Q8C8K6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atxn7l2Q8C8K6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Atxn7l2Q8C8K6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Atxn7l2Q8C8K6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atxn7l2Q8C8K6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atxn7l2Q8C8K6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atxn7l2Q8C8K6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atxn7l2Q8C8K6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atxn7l2Q8C8K6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atxn7l2Q8C8K6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atxn7l2Q8C8K6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atxn7l2Q8C8K6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Atxn7l2Q8C8K6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atxn7l2Q8C8K6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atxn7l2Q8C8K6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atxn7l2Q8C8K6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atxn7l2Q8C8K6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atxn7l2Q8C8K6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atxn7l2Q8C8K6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atxn7l2Q8C8K6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atxn7l2Q8C8K6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atxn7l2Q8C8K6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atxn7l2Q8C8K6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atxn7l2Q8C8K6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atxn7l2Q8C8K6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atxn7l2Q8C8K6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atxn7l2Q8C8K6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atxn7l2Q8C8K6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Atxn7l2Q8C8K6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atxn7l2Q8C8K6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atxn7l2Q8C8K6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atxn7l2Q8C8K6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atxn7l2Q8C8K6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atxn7l2Q8C8K6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atxn7l2Q8C8K6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atxn7l2Q8C8K6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atxn7l2Q8C8K6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atxn7l2Q8C8K6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atxn7l2Q8C8K6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atxn7l2Q8C8K6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atxn7l2Q8C8K6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atxn7l2Q8C8K6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn7l2Q8C8K6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn7l2Q8C8K6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn7l2Q8C8K6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atxn7l2Q8C8K6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atxn7l2Q8C8K6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atxn7l2Q8C8K6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atxn7l2Q8C8K6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atxn7l2Q8C8K6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atxn7l2Q8C8K6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atxn7l2Q8C8K6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atxn7l2Q8C8K6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atxn7l2Q8C8K6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atxn7l2Q8C8K6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atxn7l2Q8C8K6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atxn7l2Q8C8K6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atxn7l2Q8C8K6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atxn7l2Q8C8K6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atxn7l2Q8C8K6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atxn7l2Q8C8K6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atxn7l2Q8C8K6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atxn7l2Q8C8K6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atxn7l2Q8C8K6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atxn7l2Q8C8K6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atxn7l2Q8C8K6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atxn7l2Q8C8K6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atxn7l2Q8C8K6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atxn7l2Q8C8K6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atxn7l2Q8C8K6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atxn7l2Q8C8K6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atxn7l2Q8C8K6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atxn7l2Q8C8K6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atxn7l2Q8C8K6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atxn7l2Q8C8K6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atxn7l2Q8C8K6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn7l2Q8C8K6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn7l2Q8C8K6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn7l2Q8C8K6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn7l2Q8C8K6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Atxn7l2Q8C8K6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atxn7l2Q8C8K6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atxn7l2Q8C8K6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn7l2Q8C8K6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms