Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLK3

Lsamp, Limbic system-associated membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsampQ8BLK3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LsampQ8BLK3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LsampQ8BLK3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LsampQ8BLK3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LsampQ8BLK3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LsampQ8BLK3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LsampQ8BLK3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LsampQ8BLK3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LsampQ8BLK3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LsampQ8BLK3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LsampQ8BLK3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LsampQ8BLK3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LsampQ8BLK3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LsampQ8BLK3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LsampQ8BLK3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LsampQ8BLK3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LsampQ8BLK3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LsampQ8BLK3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LsampQ8BLK3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LsampQ8BLK3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LsampQ8BLK3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LsampQ8BLK3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LsampQ8BLK3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LsampQ8BLK3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LsampQ8BLK3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LsampQ8BLK3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LsampQ8BLK3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LsampQ8BLK3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LsampQ8BLK3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
LsampQ8BLK3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LsampQ8BLK3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LsampQ8BLK3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LsampQ8BLK3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LsampQ8BLK3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LsampQ8BLK3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LsampQ8BLK3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LsampQ8BLK3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LsampQ8BLK3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LsampQ8BLK3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LsampQ8BLK3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LsampQ8BLK3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LsampQ8BLK3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LsampQ8BLK3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LsampQ8BLK3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LsampQ8BLK3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LsampQ8BLK3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LsampQ8BLK3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LsampQ8BLK3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LsampQ8BLK3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LsampQ8BLK3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LsampQ8BLK3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LsampQ8BLK3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LsampQ8BLK3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LsampQ8BLK3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LsampQ8BLK3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LsampQ8BLK3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LsampQ8BLK3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LsampQ8BLK3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LsampQ8BLK3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LsampQ8BLK3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LsampQ8BLK3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LsampQ8BLK3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LsampQ8BLK3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LsampQ8BLK3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LsampQ8BLK3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LsampQ8BLK3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LsampQ8BLK3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LsampQ8BLK3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LsampQ8BLK3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LsampQ8BLK3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LsampQ8BLK3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LsampQ8BLK3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LsampQ8BLK3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LsampQ8BLK3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LsampQ8BLK3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LsampQ8BLK3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LsampQ8BLK3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LsampQ8BLK3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LsampQ8BLK3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LsampQ8BLK3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LsampQ8BLK3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LsampQ8BLK3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LsampQ8BLK3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LsampQ8BLK3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LsampQ8BLK3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LsampQ8BLK3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LsampQ8BLK3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LsampQ8BLK3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LsampQ8BLK3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LsampQ8BLK3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LsampQ8BLK3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LsampQ8BLK3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LsampQ8BLK3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LsampQ8BLK3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LsampQ8BLK3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LsampQ8BLK3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LsampQ8BLK3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LsampQ8BLK3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LsampQ8BLK3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LsampQ8BLK3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms