Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smndc1Q8BGT7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smndc1Q8BGT7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smndc1Q8BGT7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Smndc1Q8BGT7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Smndc1Q8BGT7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smndc1Q8BGT7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smndc1Q8BGT7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smndc1Q8BGT7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smndc1Q8BGT7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smndc1Q8BGT7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smndc1Q8BGT7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smndc1Q8BGT7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smndc1Q8BGT7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smndc1Q8BGT7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smndc1Q8BGT7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smndc1Q8BGT7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smndc1Q8BGT7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smndc1Q8BGT7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smndc1Q8BGT7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Smndc1Q8BGT7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smndc1Q8BGT7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smndc1Q8BGT7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smndc1Q8BGT7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smndc1Q8BGT7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smndc1Q8BGT7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smndc1Q8BGT7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smndc1Q8BGT7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Smndc1Q8BGT7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smndc1Q8BGT7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smndc1Q8BGT7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smndc1Q8BGT7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smndc1Q8BGT7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smndc1Q8BGT7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smndc1Q8BGT7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smndc1Q8BGT7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smndc1Q8BGT7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smndc1Q8BGT7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smndc1Q8BGT7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smndc1Q8BGT7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smndc1Q8BGT7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smndc1Q8BGT7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smndc1Q8BGT7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smndc1Q8BGT7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smndc1Q8BGT7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smndc1Q8BGT7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smndc1Q8BGT7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smndc1Q8BGT7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smndc1Q8BGT7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smndc1Q8BGT7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smndc1Q8BGT7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smndc1Q8BGT7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Smndc1Q8BGT7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smndc1Q8BGT7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smndc1Q8BGT7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smndc1Q8BGT7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smndc1Q8BGT7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smndc1Q8BGT7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smndc1Q8BGT7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smndc1Q8BGT7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smndc1Q8BGT7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smndc1Q8BGT7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smndc1Q8BGT7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smndc1Q8BGT7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smndc1Q8BGT7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smndc1Q8BGT7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smndc1Q8BGT7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Smndc1Q8BGT7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smndc1Q8BGT7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smndc1Q8BGT7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smndc1Q8BGT7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smndc1Q8BGT7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smndc1Q8BGT7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smndc1Q8BGT7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smndc1Q8BGT7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smndc1Q8BGT7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smndc1Q8BGT7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smndc1Q8BGT7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smndc1Q8BGT7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smndc1Q8BGT7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smndc1Q8BGT7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smndc1Q8BGT7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Smndc1Q8BGT7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smndc1Q8BGT7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smndc1Q8BGT7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Smndc1Q8BGT7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smndc1Q8BGT7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smndc1Q8BGT7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smndc1Q8BGT7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smndc1Q8BGT7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smndc1Q8BGT7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smndc1Q8BGT7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smndc1Q8BGT7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smndc1Q8BGT7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smndc1Q8BGT7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smndc1Q8BGT7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smndc1Q8BGT7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smndc1Q8BGT7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smndc1Q8BGT7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smndc1Q8BGT7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms