Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU5

Ccdc181, Coiled-coil domain-containing protein 181, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc181Q80ZU5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc181Q80ZU5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc181Q80ZU5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc181Q80ZU5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc181Q80ZU5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc181Q80ZU5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc181Q80ZU5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc181Q80ZU5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc181Q80ZU5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc181Q80ZU5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc181Q80ZU5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc181Q80ZU5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc181Q80ZU5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc181Q80ZU5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc181Q80ZU5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc181Q80ZU5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc181Q80ZU5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc181Q80ZU5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc181Q80ZU5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc181Q80ZU5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc181Q80ZU5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc181Q80ZU5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc181Q80ZU5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc181Q80ZU5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc181Q80ZU5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc181Q80ZU5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc181Q80ZU5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc181Q80ZU5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc181Q80ZU5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc181Q80ZU5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc181Q80ZU5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc181Q80ZU5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc181Q80ZU5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc181Q80ZU5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc181Q80ZU5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc181Q80ZU5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc181Q80ZU5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc181Q80ZU5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc181Q80ZU5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc181Q80ZU5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc181Q80ZU5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc181Q80ZU5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc181Q80ZU5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc181Q80ZU5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc181Q80ZU5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc181Q80ZU5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc181Q80ZU5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc181Q80ZU5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc181Q80ZU5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc181Q80ZU5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc181Q80ZU5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ccdc181Q80ZU5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc181Q80ZU5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc181Q80ZU5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc181Q80ZU5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc181Q80ZU5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc181Q80ZU5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc181Q80ZU5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc181Q80ZU5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc181Q80ZU5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc181Q80ZU5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc181Q80ZU5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc181Q80ZU5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc181Q80ZU5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc181Q80ZU5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc181Q80ZU5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc181Q80ZU5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc181Q80ZU5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc181Q80ZU5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc181Q80ZU5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc181Q80ZU5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc181Q80ZU5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc181Q80ZU5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc181Q80ZU5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc181Q80ZU5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc181Q80ZU5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc181Q80ZU5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc181Q80ZU5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc181Q80ZU5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc181Q80ZU5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc181Q80ZU5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc181Q80ZU5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc181Q80ZU5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc181Q80ZU5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc181Q80ZU5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc181Q80ZU5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc181Q80ZU5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc181Q80ZU5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccdc181Q80ZU5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc181Q80ZU5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc181Q80ZU5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc181Q80ZU5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc181Q80ZU5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc181Q80ZU5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc181Q80ZU5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc181Q80ZU5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc181Q80ZU5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc181Q80ZU5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc181Q80ZU5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc181Q80ZU5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms