Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZQ0

Spaca4, Sperm acrosome membrane-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spaca4Q80ZQ0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spaca4Q80ZQ0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spaca4Q80ZQ0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spaca4Q80ZQ0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spaca4Q80ZQ0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spaca4Q80ZQ0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spaca4Q80ZQ0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spaca4Q80ZQ0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spaca4Q80ZQ0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spaca4Q80ZQ0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spaca4Q80ZQ0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spaca4Q80ZQ0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spaca4Q80ZQ0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spaca4Q80ZQ0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spaca4Q80ZQ0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spaca4Q80ZQ0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spaca4Q80ZQ0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spaca4Q80ZQ0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spaca4Q80ZQ0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spaca4Q80ZQ0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spaca4Q80ZQ0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spaca4Q80ZQ0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spaca4Q80ZQ0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spaca4Q80ZQ0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spaca4Q80ZQ0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spaca4Q80ZQ0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spaca4Q80ZQ0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spaca4Q80ZQ0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spaca4Q80ZQ0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spaca4Q80ZQ0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Spaca4Q80ZQ0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spaca4Q80ZQ0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spaca4Q80ZQ0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spaca4Q80ZQ0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spaca4Q80ZQ0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spaca4Q80ZQ0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spaca4Q80ZQ0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spaca4Q80ZQ0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spaca4Q80ZQ0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spaca4Q80ZQ0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spaca4Q80ZQ0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spaca4Q80ZQ0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spaca4Q80ZQ0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spaca4Q80ZQ0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spaca4Q80ZQ0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spaca4Q80ZQ0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spaca4Q80ZQ0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spaca4Q80ZQ0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spaca4Q80ZQ0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spaca4Q80ZQ0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spaca4Q80ZQ0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spaca4Q80ZQ0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spaca4Q80ZQ0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Spaca4Q80ZQ0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spaca4Q80ZQ0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spaca4Q80ZQ0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spaca4Q80ZQ0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spaca4Q80ZQ0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spaca4Q80ZQ0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spaca4Q80ZQ0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spaca4Q80ZQ0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spaca4Q80ZQ0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Spaca4Q80ZQ0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spaca4Q80ZQ0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spaca4Q80ZQ0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spaca4Q80ZQ0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spaca4Q80ZQ0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spaca4Q80ZQ0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spaca4Q80ZQ0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spaca4Q80ZQ0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spaca4Q80ZQ0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spaca4Q80ZQ0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spaca4Q80ZQ0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spaca4Q80ZQ0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Spaca4Q80ZQ0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spaca4Q80ZQ0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spaca4Q80ZQ0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spaca4Q80ZQ0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spaca4Q80ZQ0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spaca4Q80ZQ0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spaca4Q80ZQ0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spaca4Q80ZQ0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spaca4Q80ZQ0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spaca4Q80ZQ0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Spaca4Q80ZQ0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spaca4Q80ZQ0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spaca4Q80ZQ0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spaca4Q80ZQ0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Spaca4Q80ZQ0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Spaca4Q80ZQ0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spaca4Q80ZQ0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spaca4Q80ZQ0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spaca4Q80ZQ0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spaca4Q80ZQ0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spaca4Q80ZQ0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spaca4Q80ZQ0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spaca4Q80ZQ0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spaca4Q80ZQ0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spaca4Q80ZQ0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spaca4Q80ZQ0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms