Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Amigo1Q80ZD8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Amigo1Q80ZD8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Amigo1Q80ZD8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Amigo1Q80ZD8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Amigo1Q80ZD8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Amigo1Q80ZD8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Amigo1Q80ZD8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Amigo1Q80ZD8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Amigo1Q80ZD8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Amigo1Q80ZD8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Amigo1Q80ZD8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Amigo1Q80ZD8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Amigo1Q80ZD8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Amigo1Q80ZD8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Amigo1Q80ZD8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Amigo1Q80ZD8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Amigo1Q80ZD8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Amigo1Q80ZD8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Amigo1Q80ZD8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Amigo1Q80ZD8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Amigo1Q80ZD8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Amigo1Q80ZD8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Amigo1Q80ZD8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Amigo1Q80ZD8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Amigo1Q80ZD8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Amigo1Q80ZD8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Amigo1Q80ZD8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Amigo1Q80ZD8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Amigo1Q80ZD8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Amigo1Q80ZD8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Amigo1Q80ZD8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Amigo1Q80ZD8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Amigo1Q80ZD8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Amigo1Q80ZD8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Amigo1Q80ZD8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Amigo1Q80ZD8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Amigo1Q80ZD8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Amigo1Q80ZD8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Amigo1Q80ZD8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Amigo1Q80ZD8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Amigo1Q80ZD8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Amigo1Q80ZD8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Amigo1Q80ZD8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Amigo1Q80ZD8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Amigo1Q80ZD8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Amigo1Q80ZD8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Amigo1Q80ZD8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Amigo1Q80ZD8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Amigo1Q80ZD8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Amigo1Q80ZD8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Amigo1Q80ZD8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Amigo1Q80ZD8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Amigo1Q80ZD8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Amigo1Q80ZD8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Amigo1Q80ZD8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Amigo1Q80ZD8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Amigo1Q80ZD8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Amigo1Q80ZD8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Amigo1Q80ZD8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Amigo1Q80ZD8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Amigo1Q80ZD8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Amigo1Q80ZD8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Amigo1Q80ZD8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Amigo1Q80ZD8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Amigo1Q80ZD8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Amigo1Q80ZD8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Amigo1Q80ZD8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Amigo1Q80ZD8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Amigo1Q80ZD8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Amigo1Q80ZD8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Amigo1Q80ZD8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Amigo1Q80ZD8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Amigo1Q80ZD8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Amigo1Q80ZD8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Amigo1Q80ZD8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Amigo1Q80ZD8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Amigo1Q80ZD8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Amigo1Q80ZD8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Amigo1Q80ZD8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Amigo1Q80ZD8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Amigo1Q80ZD8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Amigo1Q80ZD8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Amigo1Q80ZD8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Amigo1Q80ZD8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Amigo1Q80ZD8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Amigo1Q80ZD8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Amigo1Q80ZD8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Amigo1Q80ZD8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Amigo1Q80ZD8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Amigo1Q80ZD8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Amigo1Q80ZD8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Amigo1Q80ZD8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Amigo1Q80ZD8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Amigo1Q80ZD8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Amigo1Q80ZD8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Amigo1Q80ZD8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Amigo1Q80ZD8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Amigo1Q80ZD8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Amigo1Q80ZD8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
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