Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrrc27Q80YS5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrrc27Q80YS5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc27Q80YS5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrc27Q80YS5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrc27Q80YS5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrc27Q80YS5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc27Q80YS5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrc27Q80YS5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrc27Q80YS5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrc27Q80YS5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrrc27Q80YS5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrrc27Q80YS5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrrc27Q80YS5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrrc27Q80YS5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrrc27Q80YS5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrc27Q80YS5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrc27Q80YS5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrc27Q80YS5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrc27Q80YS5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc27Q80YS5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc27Q80YS5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc27Q80YS5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc27Q80YS5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc27Q80YS5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc27Q80YS5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc27Q80YS5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc27Q80YS5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrc27Q80YS5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lrrc27Q80YS5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lrrc27Q80YS5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lrrc27Q80YS5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lrrc27Q80YS5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc27Q80YS5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc27Q80YS5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc27Q80YS5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrrc27Q80YS5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrrc27Q80YS5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrc27Q80YS5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrrc27Q80YS5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrrc27Q80YS5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lrrc27Q80YS5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lrrc27Q80YS5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Lrrc27Q80YS5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lrrc27Q80YS5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrrc27Q80YS5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrrc27Q80YS5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrrc27Q80YS5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lrrc27Q80YS5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc27Q80YS5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrc27Q80YS5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrc27Q80YS5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrc27Q80YS5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrc27Q80YS5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc27Q80YS5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrc27Q80YS5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrc27Q80YS5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrc27Q80YS5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrc27Q80YS5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrc27Q80YS5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc27Q80YS5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc27Q80YS5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc27Q80YS5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc27Q80YS5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc27Q80YS5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc27Q80YS5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc27Q80YS5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc27Q80YS5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc27Q80YS5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc27Q80YS5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc27Q80YS5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc27Q80YS5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc27Q80YS5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc27Q80YS5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrc27Q80YS5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrc27Q80YS5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc27Q80YS5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrc27Q80YS5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrc27Q80YS5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrc27Q80YS5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrc27Q80YS5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrc27Q80YS5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrrc27Q80YS5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrrc27Q80YS5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrc27Q80YS5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrrc27Q80YS5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrc27Q80YS5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrc27Q80YS5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrc27Q80YS5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrc27Q80YS5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrc27Q80YS5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrc27Q80YS5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc27Q80YS5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc27Q80YS5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrc27Q80YS5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrc27Q80YS5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc27Q80YS5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc27Q80YS5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc27Q80YS5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc27Q80YS5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms