Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamp3Q7TST5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamp3Q7TST5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamp3Q7TST5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamp3Q7TST5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamp3Q7TST5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamp3Q7TST5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamp3Q7TST5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamp3Q7TST5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamp3Q7TST5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamp3Q7TST5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamp3Q7TST5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lamp3Q7TST5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamp3Q7TST5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamp3Q7TST5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamp3Q7TST5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamp3Q7TST5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamp3Q7TST5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamp3Q7TST5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamp3Q7TST5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamp3Q7TST5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Lamp3Q7TST5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamp3Q7TST5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamp3Q7TST5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamp3Q7TST5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamp3Q7TST5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamp3Q7TST5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamp3Q7TST5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamp3Q7TST5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamp3Q7TST5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamp3Q7TST5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamp3Q7TST5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamp3Q7TST5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamp3Q7TST5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamp3Q7TST5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lamp3Q7TST5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lamp3Q7TST5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamp3Q7TST5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lamp3Q7TST5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamp3Q7TST5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamp3Q7TST5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamp3Q7TST5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamp3Q7TST5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lamp3Q7TST5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamp3Q7TST5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamp3Q7TST5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamp3Q7TST5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamp3Q7TST5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamp3Q7TST5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamp3Q7TST5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamp3Q7TST5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamp3Q7TST5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamp3Q7TST5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamp3Q7TST5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamp3Q7TST5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamp3Q7TST5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamp3Q7TST5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamp3Q7TST5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamp3Q7TST5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamp3Q7TST5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamp3Q7TST5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamp3Q7TST5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamp3Q7TST5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamp3Q7TST5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamp3Q7TST5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamp3Q7TST5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamp3Q7TST5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamp3Q7TST5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamp3Q7TST5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamp3Q7TST5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamp3Q7TST5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamp3Q7TST5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamp3Q7TST5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamp3Q7TST5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamp3Q7TST5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamp3Q7TST5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lamp3Q7TST5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lamp3Q7TST5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lamp3Q7TST5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamp3Q7TST5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamp3Q7TST5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamp3Q7TST5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamp3Q7TST5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamp3Q7TST5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamp3Q7TST5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamp3Q7TST5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lamp3Q7TST5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lamp3Q7TST5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lamp3Q7TST5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lamp3Q7TST5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lamp3Q7TST5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lamp3Q7TST5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lamp3Q7TST5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lamp3Q7TST5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lamp3Q7TST5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lamp3Q7TST5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lamp3Q7TST5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamp3Q7TST5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamp3Q7TST5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamp3Q7TST5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms