Protein–RNA interactions for Protein: Q7M732

Rtl1, Retrotransposon-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl1Q7M732 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
Rtl1Q7M732 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC48.22■■■■■ 5.31
Rtl1Q7M732 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
Rtl1Q7M732 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.19■■■■■ 5.31
Rtl1Q7M732 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
Rtl1Q7M732 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.17■■■■■ 5.3
Rtl1Q7M732 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC48.14■■■■■ 5.3
Rtl1Q7M732 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC48.13■■■■■ 5.3
Rtl1Q7M732 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
Rtl1Q7M732 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC48.1■■■■■ 5.29
Rtl1Q7M732 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
Rtl1Q7M732 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC48.03■■■■■ 5.28
Rtl1Q7M732 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
Rtl1Q7M732 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC48.01■■■■■ 5.28
Rtl1Q7M732 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
Rtl1Q7M732 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC47.97■■■■■ 5.27
Rtl1Q7M732 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.26
Rtl1Q7M732 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
Rtl1Q7M732 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
Rtl1Q7M732 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
Rtl1Q7M732 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC47.89■■■■■ 5.26
Rtl1Q7M732 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
Rtl1Q7M732 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
Rtl1Q7M732 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC47.85■■■■■ 5.25
Rtl1Q7M732 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
Rtl1Q7M732 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
Rtl1Q7M732 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
Rtl1Q7M732 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC47.77■■■■■ 5.24
Rtl1Q7M732 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
Rtl1Q7M732 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
Rtl1Q7M732 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
Rtl1Q7M732 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC47.75■■■■■ 5.23
Rtl1Q7M732 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.72■■■■■ 5.23
Rtl1Q7M732 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
Rtl1Q7M732 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
Rtl1Q7M732 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
Rtl1Q7M732 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC47.65■■■■■ 5.22
Rtl1Q7M732 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
Rtl1Q7M732 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
Rtl1Q7M732 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
Rtl1Q7M732 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
Rtl1Q7M732 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.55■■■■■ 5.2
Rtl1Q7M732 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.55■■■■■ 5.2
Rtl1Q7M732 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
Rtl1Q7M732 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
Rtl1Q7M732 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
Rtl1Q7M732 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC47.49■■■■■ 5.19
Rtl1Q7M732 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
Rtl1Q7M732 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
Rtl1Q7M732 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC47.45■■■■■ 5.19
Rtl1Q7M732 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC47.45■■■■■ 5.19
Rtl1Q7M732 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.41■■■■■ 5.18
Rtl1Q7M732 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
Rtl1Q7M732 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC47.4■■■■■ 5.18
Rtl1Q7M732 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
Rtl1Q7M732 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
Rtl1Q7M732 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC47.3■■■■■ 5.16
Rtl1Q7M732 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC47.27■■■■■ 5.16
Rtl1Q7M732 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC47.19■■■■■ 5.15
Rtl1Q7M732 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
Rtl1Q7M732 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
Rtl1Q7M732 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC47.17■■■■■ 5.14
Rtl1Q7M732 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
Rtl1Q7M732 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
Rtl1Q7M732 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC47.08■■■■■ 5.13
Rtl1Q7M732 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
Rtl1Q7M732 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
Rtl1Q7M732 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
Rtl1Q7M732 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.97■■■■■ 5.11
Rtl1Q7M732 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
Rtl1Q7M732 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
Rtl1Q7M732 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
Rtl1Q7M732 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
Rtl1Q7M732 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC46.93■■■■■ 5.1
Rtl1Q7M732 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.93■■■■■ 5.1
Rtl1Q7M732 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
Rtl1Q7M732 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
Rtl1Q7M732 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC46.85■■■■■ 5.09
Rtl1Q7M732 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
Rtl1Q7M732 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
Rtl1Q7M732 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
Rtl1Q7M732 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
Rtl1Q7M732 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
Rtl1Q7M732 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
Rtl1Q7M732 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
Rtl1Q7M732 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
Rtl1Q7M732 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC46.7■■■■■ 5.07
Rtl1Q7M732 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.69■■■■■ 5.06
Rtl1Q7M732 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.68■■■■■ 5.06
Rtl1Q7M732 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC46.68■■■■■ 5.06
Rtl1Q7M732 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.67■■■■■ 5.06
Rtl1Q7M732 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
Rtl1Q7M732 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC46.65■■■■■ 5.06
Rtl1Q7M732 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC46.64■■■■■ 5.06
Rtl1Q7M732 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
Rtl1Q7M732 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.05
Rtl1Q7M732 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.05
Rtl1Q7M732 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC46.61■■■■■ 5.05
Rtl1Q7M732 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.61■■■■■ 5.05
Rtl1Q7M732 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC46.61■■■■■ 5.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms