Protein–RNA interactions for Protein: Q78PG9

Ccdc25, Coiled-coil domain-containing protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc25Q78PG9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc25Q78PG9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc25Q78PG9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc25Q78PG9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc25Q78PG9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc25Q78PG9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc25Q78PG9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc25Q78PG9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc25Q78PG9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc25Q78PG9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc25Q78PG9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc25Q78PG9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc25Q78PG9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc25Q78PG9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc25Q78PG9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc25Q78PG9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc25Q78PG9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc25Q78PG9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc25Q78PG9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc25Q78PG9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc25Q78PG9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc25Q78PG9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc25Q78PG9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc25Q78PG9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc25Q78PG9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc25Q78PG9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc25Q78PG9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc25Q78PG9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc25Q78PG9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc25Q78PG9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc25Q78PG9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc25Q78PG9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc25Q78PG9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc25Q78PG9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc25Q78PG9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc25Q78PG9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc25Q78PG9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc25Q78PG9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc25Q78PG9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc25Q78PG9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc25Q78PG9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc25Q78PG9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc25Q78PG9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc25Q78PG9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc25Q78PG9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc25Q78PG9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc25Q78PG9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc25Q78PG9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc25Q78PG9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc25Q78PG9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc25Q78PG9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc25Q78PG9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc25Q78PG9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc25Q78PG9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc25Q78PG9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc25Q78PG9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc25Q78PG9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc25Q78PG9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc25Q78PG9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc25Q78PG9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc25Q78PG9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc25Q78PG9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc25Q78PG9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc25Q78PG9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc25Q78PG9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc25Q78PG9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc25Q78PG9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc25Q78PG9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc25Q78PG9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc25Q78PG9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc25Q78PG9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc25Q78PG9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc25Q78PG9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc25Q78PG9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc25Q78PG9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc25Q78PG9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc25Q78PG9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc25Q78PG9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc25Q78PG9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc25Q78PG9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc25Q78PG9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc25Q78PG9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc25Q78PG9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc25Q78PG9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc25Q78PG9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc25Q78PG9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc25Q78PG9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc25Q78PG9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc25Q78PG9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc25Q78PG9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc25Q78PG9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc25Q78PG9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc25Q78PG9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc25Q78PG9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc25Q78PG9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc25Q78PG9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc25Q78PG9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc25Q78PG9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc25Q78PG9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc25Q78PG9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms