Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR4

Ppp2r2b, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r2bQ6ZWR4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp2r2bQ6ZWR4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp2r2bQ6ZWR4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp2r2bQ6ZWR4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp2r2bQ6ZWR4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp2r2bQ6ZWR4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp2r2bQ6ZWR4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp2r2bQ6ZWR4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp2r2bQ6ZWR4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp2r2bQ6ZWR4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp2r2bQ6ZWR4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp2r2bQ6ZWR4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp2r2bQ6ZWR4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp2r2bQ6ZWR4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp2r2bQ6ZWR4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp2r2bQ6ZWR4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp2r2bQ6ZWR4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp2r2bQ6ZWR4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppp2r2bQ6ZWR4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppp2r2bQ6ZWR4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp2r2bQ6ZWR4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp2r2bQ6ZWR4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ppp2r2bQ6ZWR4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp2r2bQ6ZWR4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp2r2bQ6ZWR4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp2r2bQ6ZWR4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp2r2bQ6ZWR4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppp2r2bQ6ZWR4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp2r2bQ6ZWR4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp2r2bQ6ZWR4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp2r2bQ6ZWR4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppp2r2bQ6ZWR4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms