Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfap2eQ6VUP9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfap2eQ6VUP9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfap2eQ6VUP9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfap2eQ6VUP9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfap2eQ6VUP9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tfap2eQ6VUP9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfap2eQ6VUP9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfap2eQ6VUP9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfap2eQ6VUP9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfap2eQ6VUP9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfap2eQ6VUP9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfap2eQ6VUP9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfap2eQ6VUP9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfap2eQ6VUP9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfap2eQ6VUP9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfap2eQ6VUP9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfap2eQ6VUP9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfap2eQ6VUP9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfap2eQ6VUP9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfap2eQ6VUP9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfap2eQ6VUP9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfap2eQ6VUP9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfap2eQ6VUP9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfap2eQ6VUP9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfap2eQ6VUP9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfap2eQ6VUP9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfap2eQ6VUP9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfap2eQ6VUP9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfap2eQ6VUP9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfap2eQ6VUP9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfap2eQ6VUP9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfap2eQ6VUP9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfap2eQ6VUP9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfap2eQ6VUP9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfap2eQ6VUP9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfap2eQ6VUP9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfap2eQ6VUP9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfap2eQ6VUP9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfap2eQ6VUP9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfap2eQ6VUP9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfap2eQ6VUP9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfap2eQ6VUP9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfap2eQ6VUP9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfap2eQ6VUP9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfap2eQ6VUP9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfap2eQ6VUP9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfap2eQ6VUP9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfap2eQ6VUP9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfap2eQ6VUP9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfap2eQ6VUP9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfap2eQ6VUP9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfap2eQ6VUP9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfap2eQ6VUP9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tfap2eQ6VUP9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tfap2eQ6VUP9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfap2eQ6VUP9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tfap2eQ6VUP9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tfap2eQ6VUP9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tfap2eQ6VUP9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfap2eQ6VUP9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfap2eQ6VUP9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfap2eQ6VUP9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfap2eQ6VUP9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfap2eQ6VUP9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfap2eQ6VUP9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfap2eQ6VUP9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfap2eQ6VUP9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfap2eQ6VUP9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfap2eQ6VUP9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfap2eQ6VUP9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfap2eQ6VUP9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfap2eQ6VUP9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfap2eQ6VUP9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfap2eQ6VUP9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfap2eQ6VUP9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfap2eQ6VUP9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfap2eQ6VUP9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfap2eQ6VUP9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfap2eQ6VUP9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tfap2eQ6VUP9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tfap2eQ6VUP9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfap2eQ6VUP9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfap2eQ6VUP9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfap2eQ6VUP9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfap2eQ6VUP9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfap2eQ6VUP9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfap2eQ6VUP9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfap2eQ6VUP9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfap2eQ6VUP9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tfap2eQ6VUP9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfap2eQ6VUP9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfap2eQ6VUP9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfap2eQ6VUP9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfap2eQ6VUP9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfap2eQ6VUP9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfap2eQ6VUP9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfap2eQ6VUP9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfap2eQ6VUP9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfap2eQ6VUP9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms