Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neil2Q6R2P8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Neil2Q6R2P8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Neil2Q6R2P8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Neil2Q6R2P8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Neil2Q6R2P8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Neil2Q6R2P8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Neil2Q6R2P8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Neil2Q6R2P8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Neil2Q6R2P8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Neil2Q6R2P8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Neil2Q6R2P8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Neil2Q6R2P8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Neil2Q6R2P8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neil2Q6R2P8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neil2Q6R2P8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neil2Q6R2P8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neil2Q6R2P8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neil2Q6R2P8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neil2Q6R2P8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neil2Q6R2P8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neil2Q6R2P8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neil2Q6R2P8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Neil2Q6R2P8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Neil2Q6R2P8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neil2Q6R2P8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neil2Q6R2P8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neil2Q6R2P8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neil2Q6R2P8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neil2Q6R2P8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neil2Q6R2P8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Neil2Q6R2P8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neil2Q6R2P8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Neil2Q6R2P8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neil2Q6R2P8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neil2Q6R2P8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Neil2Q6R2P8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Neil2Q6R2P8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neil2Q6R2P8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neil2Q6R2P8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Neil2Q6R2P8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Neil2Q6R2P8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Neil2Q6R2P8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Neil2Q6R2P8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Neil2Q6R2P8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Neil2Q6R2P8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Neil2Q6R2P8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Neil2Q6R2P8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Neil2Q6R2P8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Neil2Q6R2P8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Neil2Q6R2P8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Neil2Q6R2P8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Neil2Q6R2P8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Neil2Q6R2P8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Neil2Q6R2P8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Neil2Q6R2P8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Neil2Q6R2P8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Neil2Q6R2P8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Neil2Q6R2P8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Neil2Q6R2P8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Neil2Q6R2P8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Neil2Q6R2P8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neil2Q6R2P8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neil2Q6R2P8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neil2Q6R2P8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neil2Q6R2P8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neil2Q6R2P8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neil2Q6R2P8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Neil2Q6R2P8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Neil2Q6R2P8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Neil2Q6R2P8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Neil2Q6R2P8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Neil2Q6R2P8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Neil2Q6R2P8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Neil2Q6R2P8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Neil2Q6R2P8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neil2Q6R2P8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neil2Q6R2P8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neil2Q6R2P8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neil2Q6R2P8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neil2Q6R2P8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neil2Q6R2P8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Neil2Q6R2P8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Neil2Q6R2P8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Neil2Q6R2P8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Neil2Q6R2P8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Neil2Q6R2P8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Neil2Q6R2P8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Neil2Q6R2P8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Neil2Q6R2P8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Neil2Q6R2P8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Neil2Q6R2P8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Neil2Q6R2P8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Neil2Q6R2P8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Neil2Q6R2P8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Neil2Q6R2P8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Neil2Q6R2P8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Neil2Q6R2P8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Neil2Q6R2P8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Neil2Q6R2P8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms