Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE87

Cfap206, Cilia- and flagella-associated protein 206, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap206Q6PE87 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap206Q6PE87 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfap206Q6PE87 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cfap206Q6PE87 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cfap206Q6PE87 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cfap206Q6PE87 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cfap206Q6PE87 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cfap206Q6PE87 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cfap206Q6PE87 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cfap206Q6PE87 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cfap206Q6PE87 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cfap206Q6PE87 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cfap206Q6PE87 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cfap206Q6PE87 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cfap206Q6PE87 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cfap206Q6PE87 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cfap206Q6PE87 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cfap206Q6PE87 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cfap206Q6PE87 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cfap206Q6PE87 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cfap206Q6PE87 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cfap206Q6PE87 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfap206Q6PE87 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfap206Q6PE87 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfap206Q6PE87 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfap206Q6PE87 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cfap206Q6PE87 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cfap206Q6PE87 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfap206Q6PE87 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cfap206Q6PE87 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cfap206Q6PE87 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cfap206Q6PE87 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cfap206Q6PE87 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cfap206Q6PE87 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cfap206Q6PE87 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cfap206Q6PE87 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cfap206Q6PE87 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cfap206Q6PE87 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cfap206Q6PE87 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cfap206Q6PE87 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfap206Q6PE87 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfap206Q6PE87 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfap206Q6PE87 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfap206Q6PE87 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cfap206Q6PE87 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cfap206Q6PE87 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cfap206Q6PE87 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap206Q6PE87 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap206Q6PE87 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap206Q6PE87 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap206Q6PE87 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfap206Q6PE87 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfap206Q6PE87 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap206Q6PE87 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap206Q6PE87 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap206Q6PE87 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfap206Q6PE87 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfap206Q6PE87 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap206Q6PE87 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap206Q6PE87 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap206Q6PE87 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap206Q6PE87 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap206Q6PE87 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap206Q6PE87 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap206Q6PE87 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap206Q6PE87 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap206Q6PE87 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap206Q6PE87 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap206Q6PE87 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap206Q6PE87 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap206Q6PE87 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cfap206Q6PE87 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Cfap206Q6PE87 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cfap206Q6PE87 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap206Q6PE87 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap206Q6PE87 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap206Q6PE87 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap206Q6PE87 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap206Q6PE87 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap206Q6PE87 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap206Q6PE87 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap206Q6PE87 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap206Q6PE87 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap206Q6PE87 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap206Q6PE87 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap206Q6PE87 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap206Q6PE87 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap206Q6PE87 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap206Q6PE87 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap206Q6PE87 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap206Q6PE87 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap206Q6PE87 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap206Q6PE87 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap206Q6PE87 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap206Q6PE87 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap206Q6PE87 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfap206Q6PE87 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap206Q6PE87 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap206Q6PE87 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfap206Q6PE87 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms