Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc36Q6PDM4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc36Q6PDM4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc36Q6PDM4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc36Q6PDM4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc36Q6PDM4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc36Q6PDM4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc36Q6PDM4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc36Q6PDM4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc36Q6PDM4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc36Q6PDM4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc36Q6PDM4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc36Q6PDM4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc36Q6PDM4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc36Q6PDM4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc36Q6PDM4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc36Q6PDM4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc36Q6PDM4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc36Q6PDM4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc36Q6PDM4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc36Q6PDM4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc36Q6PDM4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc36Q6PDM4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc36Q6PDM4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc36Q6PDM4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc36Q6PDM4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc36Q6PDM4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc36Q6PDM4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc36Q6PDM4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc36Q6PDM4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc36Q6PDM4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc36Q6PDM4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc36Q6PDM4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc36Q6PDM4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc36Q6PDM4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc36Q6PDM4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc36Q6PDM4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc36Q6PDM4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc36Q6PDM4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc36Q6PDM4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc36Q6PDM4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc36Q6PDM4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc36Q6PDM4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc36Q6PDM4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc36Q6PDM4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc36Q6PDM4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc36Q6PDM4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc36Q6PDM4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc36Q6PDM4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc36Q6PDM4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc36Q6PDM4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc36Q6PDM4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc36Q6PDM4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc36Q6PDM4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc36Q6PDM4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc36Q6PDM4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc36Q6PDM4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc36Q6PDM4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc36Q6PDM4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc36Q6PDM4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc36Q6PDM4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc36Q6PDM4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc36Q6PDM4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc36Q6PDM4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc36Q6PDM4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc36Q6PDM4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc36Q6PDM4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc36Q6PDM4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc36Q6PDM4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc36Q6PDM4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc36Q6PDM4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc36Q6PDM4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc36Q6PDM4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc36Q6PDM4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc36Q6PDM4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc36Q6PDM4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc36Q6PDM4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc36Q6PDM4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc36Q6PDM4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc36Q6PDM4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc36Q6PDM4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc36Q6PDM4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc36Q6PDM4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc36Q6PDM4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc36Q6PDM4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc36Q6PDM4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc36Q6PDM4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc36Q6PDM4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc36Q6PDM4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc36Q6PDM4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc36Q6PDM4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc36Q6PDM4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc36Q6PDM4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc36Q6PDM4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc36Q6PDM4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc36Q6PDM4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc36Q6PDM4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc36Q6PDM4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms