Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fhod1Q6P9Q4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fhod1Q6P9Q4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fhod1Q6P9Q4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fhod1Q6P9Q4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Fhod1Q6P9Q4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fhod1Q6P9Q4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fhod1Q6P9Q4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Fhod1Q6P9Q4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fhod1Q6P9Q4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fhod1Q6P9Q4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fhod1Q6P9Q4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fhod1Q6P9Q4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Fhod1Q6P9Q4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fhod1Q6P9Q4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fhod1Q6P9Q4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fhod1Q6P9Q4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fhod1Q6P9Q4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fhod1Q6P9Q4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fhod1Q6P9Q4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fhod1Q6P9Q4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fhod1Q6P9Q4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fhod1Q6P9Q4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fhod1Q6P9Q4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fhod1Q6P9Q4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fhod1Q6P9Q4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fhod1Q6P9Q4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fhod1Q6P9Q4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fhod1Q6P9Q4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fhod1Q6P9Q4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fhod1Q6P9Q4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fhod1Q6P9Q4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fhod1Q6P9Q4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fhod1Q6P9Q4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fhod1Q6P9Q4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Fhod1Q6P9Q4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fhod1Q6P9Q4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fhod1Q6P9Q4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fhod1Q6P9Q4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fhod1Q6P9Q4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Fhod1Q6P9Q4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fhod1Q6P9Q4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fhod1Q6P9Q4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fhod1Q6P9Q4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fhod1Q6P9Q4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fhod1Q6P9Q4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fhod1Q6P9Q4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fhod1Q6P9Q4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fhod1Q6P9Q4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fhod1Q6P9Q4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fhod1Q6P9Q4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fhod1Q6P9Q4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Fhod1Q6P9Q4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fhod1Q6P9Q4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fhod1Q6P9Q4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fhod1Q6P9Q4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fhod1Q6P9Q4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Fhod1Q6P9Q4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fhod1Q6P9Q4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fhod1Q6P9Q4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fhod1Q6P9Q4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fhod1Q6P9Q4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fhod1Q6P9Q4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fhod1Q6P9Q4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fhod1Q6P9Q4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fhod1Q6P9Q4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fhod1Q6P9Q4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fhod1Q6P9Q4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fhod1Q6P9Q4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fhod1Q6P9Q4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fhod1Q6P9Q4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fhod1Q6P9Q4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fhod1Q6P9Q4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Fhod1Q6P9Q4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Fhod1Q6P9Q4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fhod1Q6P9Q4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fhod1Q6P9Q4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fhod1Q6P9Q4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Fhod1Q6P9Q4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fhod1Q6P9Q4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fhod1Q6P9Q4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fhod1Q6P9Q4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fhod1Q6P9Q4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fhod1Q6P9Q4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fhod1Q6P9Q4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fhod1Q6P9Q4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fhod1Q6P9Q4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fhod1Q6P9Q4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fhod1Q6P9Q4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fhod1Q6P9Q4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fhod1Q6P9Q4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fhod1Q6P9Q4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fhod1Q6P9Q4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fhod1Q6P9Q4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Fhod1Q6P9Q4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Fhod1Q6P9Q4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fhod1Q6P9Q4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fhod1Q6P9Q4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fhod1Q6P9Q4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fhod1Q6P9Q4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms