Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6J4

Alkbh2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh2Q6P6J4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alkbh2Q6P6J4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alkbh2Q6P6J4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alkbh2Q6P6J4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alkbh2Q6P6J4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alkbh2Q6P6J4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alkbh2Q6P6J4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alkbh2Q6P6J4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alkbh2Q6P6J4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alkbh2Q6P6J4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alkbh2Q6P6J4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Alkbh2Q6P6J4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alkbh2Q6P6J4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alkbh2Q6P6J4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alkbh2Q6P6J4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alkbh2Q6P6J4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkbh2Q6P6J4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkbh2Q6P6J4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Alkbh2Q6P6J4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alkbh2Q6P6J4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alkbh2Q6P6J4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alkbh2Q6P6J4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alkbh2Q6P6J4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alkbh2Q6P6J4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alkbh2Q6P6J4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alkbh2Q6P6J4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alkbh2Q6P6J4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh2Q6P6J4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh2Q6P6J4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh2Q6P6J4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh2Q6P6J4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alkbh2Q6P6J4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alkbh2Q6P6J4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alkbh2Q6P6J4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alkbh2Q6P6J4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alkbh2Q6P6J4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkbh2Q6P6J4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkbh2Q6P6J4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkbh2Q6P6J4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkbh2Q6P6J4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alkbh2Q6P6J4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alkbh2Q6P6J4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alkbh2Q6P6J4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Alkbh2Q6P6J4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Alkbh2Q6P6J4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Alkbh2Q6P6J4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Alkbh2Q6P6J4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alkbh2Q6P6J4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alkbh2Q6P6J4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alkbh2Q6P6J4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alkbh2Q6P6J4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Alkbh2Q6P6J4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Alkbh2Q6P6J4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Alkbh2Q6P6J4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Alkbh2Q6P6J4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Alkbh2Q6P6J4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Alkbh2Q6P6J4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Alkbh2Q6P6J4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Alkbh2Q6P6J4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Alkbh2Q6P6J4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Alkbh2Q6P6J4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Alkbh2Q6P6J4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Alkbh2Q6P6J4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Alkbh2Q6P6J4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Alkbh2Q6P6J4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Alkbh2Q6P6J4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Alkbh2Q6P6J4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Alkbh2Q6P6J4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Alkbh2Q6P6J4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Alkbh2Q6P6J4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Alkbh2Q6P6J4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Alkbh2Q6P6J4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Alkbh2Q6P6J4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Alkbh2Q6P6J4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Alkbh2Q6P6J4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Alkbh2Q6P6J4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Alkbh2Q6P6J4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Alkbh2Q6P6J4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Alkbh2Q6P6J4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Alkbh2Q6P6J4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alkbh2Q6P6J4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Alkbh2Q6P6J4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Alkbh2Q6P6J4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Alkbh2Q6P6J4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Alkbh2Q6P6J4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Alkbh2Q6P6J4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Alkbh2Q6P6J4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Alkbh2Q6P6J4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Alkbh2Q6P6J4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Alkbh2Q6P6J4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Alkbh2Q6P6J4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Alkbh2Q6P6J4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Alkbh2Q6P6J4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Alkbh2Q6P6J4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Alkbh2Q6P6J4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Alkbh2Q6P6J4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Alkbh2Q6P6J4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Alkbh2Q6P6J4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Alkbh2Q6P6J4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Alkbh2Q6P6J4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms