Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrc8eQ66JT1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc8eQ66JT1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrc8eQ66JT1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrc8eQ66JT1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc8eQ66JT1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrc8eQ66JT1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrrc8eQ66JT1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrc8eQ66JT1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrrc8eQ66JT1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrrc8eQ66JT1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrrc8eQ66JT1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc8eQ66JT1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc8eQ66JT1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc8eQ66JT1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc8eQ66JT1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc8eQ66JT1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc8eQ66JT1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc8eQ66JT1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc8eQ66JT1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc8eQ66JT1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc8eQ66JT1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc8eQ66JT1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc8eQ66JT1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc8eQ66JT1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc8eQ66JT1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc8eQ66JT1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc8eQ66JT1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc8eQ66JT1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc8eQ66JT1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc8eQ66JT1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc8eQ66JT1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc8eQ66JT1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc8eQ66JT1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc8eQ66JT1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrc8eQ66JT1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Lrrc8eQ66JT1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrc8eQ66JT1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc8eQ66JT1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc8eQ66JT1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc8eQ66JT1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc8eQ66JT1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lrrc8eQ66JT1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc8eQ66JT1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc8eQ66JT1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc8eQ66JT1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc8eQ66JT1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc8eQ66JT1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc8eQ66JT1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc8eQ66JT1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc8eQ66JT1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc8eQ66JT1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc8eQ66JT1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc8eQ66JT1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc8eQ66JT1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc8eQ66JT1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc8eQ66JT1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc8eQ66JT1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc8eQ66JT1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc8eQ66JT1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc8eQ66JT1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc8eQ66JT1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc8eQ66JT1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc8eQ66JT1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc8eQ66JT1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc8eQ66JT1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrrc8eQ66JT1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc8eQ66JT1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc8eQ66JT1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc8eQ66JT1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc8eQ66JT1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc8eQ66JT1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc8eQ66JT1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc8eQ66JT1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc8eQ66JT1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc8eQ66JT1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc8eQ66JT1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc8eQ66JT1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc8eQ66JT1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc8eQ66JT1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrc8eQ66JT1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc8eQ66JT1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc8eQ66JT1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc8eQ66JT1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc8eQ66JT1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc8eQ66JT1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc8eQ66JT1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc8eQ66JT1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc8eQ66JT1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc8eQ66JT1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc8eQ66JT1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc8eQ66JT1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lrrc8eQ66JT1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc8eQ66JT1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc8eQ66JT1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrc8eQ66JT1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrc8eQ66JT1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc8eQ66JT1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.8 ms