Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp2a3Q64518 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp2a3Q64518 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp2a3Q64518 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp2a3Q64518 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp2a3Q64518 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp2a3Q64518 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp2a3Q64518 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp2a3Q64518 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Atp2a3Q64518 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp2a3Q64518 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp2a3Q64518 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp2a3Q64518 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp2a3Q64518 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp2a3Q64518 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Atp2a3Q64518 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp2a3Q64518 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp2a3Q64518 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp2a3Q64518 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp2a3Q64518 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp2a3Q64518 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp2a3Q64518 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp2a3Q64518 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp2a3Q64518 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp2a3Q64518 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp2a3Q64518 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp2a3Q64518 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp2a3Q64518 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atp2a3Q64518 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atp2a3Q64518 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp2a3Q64518 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp2a3Q64518 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp2a3Q64518 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp2a3Q64518 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp2a3Q64518 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp2a3Q64518 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp2a3Q64518 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp2a3Q64518 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp2a3Q64518 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp2a3Q64518 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp2a3Q64518 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp2a3Q64518 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp2a3Q64518 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp2a3Q64518 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp2a3Q64518 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp2a3Q64518 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp2a3Q64518 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp2a3Q64518 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp2a3Q64518 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp2a3Q64518 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp2a3Q64518 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp2a3Q64518 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp2a3Q64518 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp2a3Q64518 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp2a3Q64518 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp2a3Q64518 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp2a3Q64518 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp2a3Q64518 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp2a3Q64518 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp2a3Q64518 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp2a3Q64518 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp2a3Q64518 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp2a3Q64518 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp2a3Q64518 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp2a3Q64518 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp2a3Q64518 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2a3Q64518 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2a3Q64518 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Atp2a3Q64518 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp2a3Q64518 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp2a3Q64518 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp2a3Q64518 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp2a3Q64518 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp2a3Q64518 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2a3Q64518 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2a3Q64518 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp2a3Q64518 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp2a3Q64518 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp2a3Q64518 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2a3Q64518 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp2a3Q64518 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp2a3Q64518 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp2a3Q64518 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp2a3Q64518 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp2a3Q64518 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2a3Q64518 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2a3Q64518 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2a3Q64518 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp2a3Q64518 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp2a3Q64518 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp2a3Q64518 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp2a3Q64518 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp2a3Q64518 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp2a3Q64518 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp2a3Q64518 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp2a3Q64518 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp2a3Q64518 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp2a3Q64518 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp2a3Q64518 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp2a3Q64518 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms