Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pan3Q640Q5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pan3Q640Q5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pan3Q640Q5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pan3Q640Q5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pan3Q640Q5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pan3Q640Q5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pan3Q640Q5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pan3Q640Q5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pan3Q640Q5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pan3Q640Q5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pan3Q640Q5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pan3Q640Q5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pan3Q640Q5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pan3Q640Q5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pan3Q640Q5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pan3Q640Q5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pan3Q640Q5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pan3Q640Q5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pan3Q640Q5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pan3Q640Q5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pan3Q640Q5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pan3Q640Q5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pan3Q640Q5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pan3Q640Q5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pan3Q640Q5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pan3Q640Q5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pan3Q640Q5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pan3Q640Q5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pan3Q640Q5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pan3Q640Q5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pan3Q640Q5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pan3Q640Q5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pan3Q640Q5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pan3Q640Q5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pan3Q640Q5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pan3Q640Q5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pan3Q640Q5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pan3Q640Q5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pan3Q640Q5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pan3Q640Q5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pan3Q640Q5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pan3Q640Q5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pan3Q640Q5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pan3Q640Q5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pan3Q640Q5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pan3Q640Q5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pan3Q640Q5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pan3Q640Q5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pan3Q640Q5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pan3Q640Q5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pan3Q640Q5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pan3Q640Q5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pan3Q640Q5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pan3Q640Q5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pan3Q640Q5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pan3Q640Q5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pan3Q640Q5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pan3Q640Q5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pan3Q640Q5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pan3Q640Q5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pan3Q640Q5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pan3Q640Q5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pan3Q640Q5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pan3Q640Q5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pan3Q640Q5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pan3Q640Q5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pan3Q640Q5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pan3Q640Q5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pan3Q640Q5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pan3Q640Q5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pan3Q640Q5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pan3Q640Q5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pan3Q640Q5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pan3Q640Q5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pan3Q640Q5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pan3Q640Q5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pan3Q640Q5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pan3Q640Q5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pan3Q640Q5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pan3Q640Q5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pan3Q640Q5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pan3Q640Q5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pan3Q640Q5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pan3Q640Q5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pan3Q640Q5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms