Protein–RNA interactions for Protein: Q62312

Tgfbr2, TGF-beta receptor type-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr2Q62312 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfbr2Q62312 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfbr2Q62312 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfbr2Q62312 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfbr2Q62312 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfbr2Q62312 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfbr2Q62312 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfbr2Q62312 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfbr2Q62312 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfbr2Q62312 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgfbr2Q62312 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgfbr2Q62312 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgfbr2Q62312 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgfbr2Q62312 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgfbr2Q62312 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgfbr2Q62312 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgfbr2Q62312 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgfbr2Q62312 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgfbr2Q62312 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgfbr2Q62312 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgfbr2Q62312 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgfbr2Q62312 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgfbr2Q62312 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgfbr2Q62312 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgfbr2Q62312 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgfbr2Q62312 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgfbr2Q62312 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgfbr2Q62312 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgfbr2Q62312 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgfbr2Q62312 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgfbr2Q62312 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgfbr2Q62312 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgfbr2Q62312 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgfbr2Q62312 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgfbr2Q62312 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgfbr2Q62312 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgfbr2Q62312 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgfbr2Q62312 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgfbr2Q62312 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgfbr2Q62312 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgfbr2Q62312 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgfbr2Q62312 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgfbr2Q62312 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgfbr2Q62312 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgfbr2Q62312 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgfbr2Q62312 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgfbr2Q62312 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfbr2Q62312 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfbr2Q62312 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfbr2Q62312 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfbr2Q62312 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfbr2Q62312 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfbr2Q62312 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfbr2Q62312 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfbr2Q62312 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tgfbr2Q62312 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tgfbr2Q62312 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tgfbr2Q62312 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgfbr2Q62312 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgfbr2Q62312 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgfbr2Q62312 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tgfbr2Q62312 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tgfbr2Q62312 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tgfbr2Q62312 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tgfbr2Q62312 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tgfbr2Q62312 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tgfbr2Q62312 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tgfbr2Q62312 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tgfbr2Q62312 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgfbr2Q62312 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgfbr2Q62312 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgfbr2Q62312 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgfbr2Q62312 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgfbr2Q62312 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgfbr2Q62312 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgfbr2Q62312 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tgfbr2Q62312 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tgfbr2Q62312 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tgfbr2Q62312 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tgfbr2Q62312 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tgfbr2Q62312 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tgfbr2Q62312 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tgfbr2Q62312 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tgfbr2Q62312 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tgfbr2Q62312 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tgfbr2Q62312 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tgfbr2Q62312 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tgfbr2Q62312 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tgfbr2Q62312 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tgfbr2Q62312 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tgfbr2Q62312 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tgfbr2Q62312 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfbr2Q62312 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfbr2Q62312 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfbr2Q62312 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgfbr2Q62312 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgfbr2Q62312 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgfbr2Q62312 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgfbr2Q62312 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgfbr2Q62312 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms