Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sema4bQ62179 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sema4bQ62179 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sema4bQ62179 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sema4bQ62179 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sema4bQ62179 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sema4bQ62179 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sema4bQ62179 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sema4bQ62179 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sema4bQ62179 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Sema4bQ62179 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sema4bQ62179 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sema4bQ62179 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sema4bQ62179 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sema4bQ62179 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sema4bQ62179 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sema4bQ62179 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sema4bQ62179 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Sema4bQ62179 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sema4bQ62179 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sema4bQ62179 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sema4bQ62179 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sema4bQ62179 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sema4bQ62179 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sema4bQ62179 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sema4bQ62179 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sema4bQ62179 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sema4bQ62179 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sema4bQ62179 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Sema4bQ62179 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sema4bQ62179 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sema4bQ62179 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Sema4bQ62179 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sema4bQ62179 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Sema4bQ62179 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sema4bQ62179 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sema4bQ62179 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Sema4bQ62179 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sema4bQ62179 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sema4bQ62179 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sema4bQ62179 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sema4bQ62179 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Sema4bQ62179 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sema4bQ62179 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sema4bQ62179 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sema4bQ62179 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sema4bQ62179 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sema4bQ62179 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sema4bQ62179 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sema4bQ62179 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sema4bQ62179 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sema4bQ62179 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sema4bQ62179 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Sema4bQ62179 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sema4bQ62179 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sema4bQ62179 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sema4bQ62179 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sema4bQ62179 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Sema4bQ62179 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sema4bQ62179 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sema4bQ62179 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sema4bQ62179 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sema4bQ62179 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sema4bQ62179 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sema4bQ62179 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sema4bQ62179 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sema4bQ62179 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sema4bQ62179 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sema4bQ62179 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sema4bQ62179 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sema4bQ62179 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Sema4bQ62179 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sema4bQ62179 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sema4bQ62179 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sema4bQ62179 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sema4bQ62179 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sema4bQ62179 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sema4bQ62179 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sema4bQ62179 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sema4bQ62179 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Sema4bQ62179 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sema4bQ62179 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sema4bQ62179 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sema4bQ62179 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sema4bQ62179 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sema4bQ62179 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sema4bQ62179 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sema4bQ62179 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sema4bQ62179 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sema4bQ62179 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Sema4bQ62179 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sema4bQ62179 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sema4bQ62179 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sema4bQ62179 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Sema4bQ62179 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sema4bQ62179 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sema4bQ62179 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sema4bQ62179 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sema4bQ62179 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sema4bQ62179 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms