Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Laptm4aQ60961 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Laptm4aQ60961 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Laptm4aQ60961 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Laptm4aQ60961 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Laptm4aQ60961 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Laptm4aQ60961 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Laptm4aQ60961 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Laptm4aQ60961 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Laptm4aQ60961 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Laptm4aQ60961 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Laptm4aQ60961 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Laptm4aQ60961 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Laptm4aQ60961 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Laptm4aQ60961 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Laptm4aQ60961 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Laptm4aQ60961 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Laptm4aQ60961 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Laptm4aQ60961 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Laptm4aQ60961 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Laptm4aQ60961 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Laptm4aQ60961 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Laptm4aQ60961 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Laptm4aQ60961 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Laptm4aQ60961 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Laptm4aQ60961 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Laptm4aQ60961 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Laptm4aQ60961 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Laptm4aQ60961 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Laptm4aQ60961 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Laptm4aQ60961 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Laptm4aQ60961 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Laptm4aQ60961 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Laptm4aQ60961 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Laptm4aQ60961 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Laptm4aQ60961 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Laptm4aQ60961 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Laptm4aQ60961 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Laptm4aQ60961 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Laptm4aQ60961 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Laptm4aQ60961 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Laptm4aQ60961 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Laptm4aQ60961 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Laptm4aQ60961 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Laptm4aQ60961 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Laptm4aQ60961 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Laptm4aQ60961 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Laptm4aQ60961 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Laptm4aQ60961 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Laptm4aQ60961 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Laptm4aQ60961 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Laptm4aQ60961 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Laptm4aQ60961 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Laptm4aQ60961 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Laptm4aQ60961 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Laptm4aQ60961 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Laptm4aQ60961 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Laptm4aQ60961 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Laptm4aQ60961 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Laptm4aQ60961 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Laptm4aQ60961 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Laptm4aQ60961 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Laptm4aQ60961 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Laptm4aQ60961 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Laptm4aQ60961 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Laptm4aQ60961 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Laptm4aQ60961 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Laptm4aQ60961 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Laptm4aQ60961 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Laptm4aQ60961 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Laptm4aQ60961 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Laptm4aQ60961 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Laptm4aQ60961 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Laptm4aQ60961 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Laptm4aQ60961 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Laptm4aQ60961 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Laptm4aQ60961 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Laptm4aQ60961 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Laptm4aQ60961 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Laptm4aQ60961 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Laptm4aQ60961 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Laptm4aQ60961 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Laptm4aQ60961 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Laptm4aQ60961 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Laptm4aQ60961 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Laptm4aQ60961 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Laptm4aQ60961 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Laptm4aQ60961 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Laptm4aQ60961 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Laptm4aQ60961 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Laptm4aQ60961 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Laptm4aQ60961 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Laptm4aQ60961 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Laptm4aQ60961 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Laptm4aQ60961 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Laptm4aQ60961 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Laptm4aQ60961 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Laptm4aQ60961 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Laptm4aQ60961 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Laptm4aQ60961 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms