Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT6

Zkscan4, MCG23028, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan4Q5SZT6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Zkscan4Q5SZT6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Zkscan4Q5SZT6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Zkscan4Q5SZT6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Zkscan4Q5SZT6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Zkscan4Q5SZT6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Zkscan4Q5SZT6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,76■■■□□ 2,2
Zkscan4Q5SZT6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Zkscan4Q5SZT6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Zkscan4Q5SZT6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Zkscan4Q5SZT6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Zkscan4Q5SZT6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Zkscan4Q5SZT6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Zkscan4Q5SZT6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Zkscan4Q5SZT6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Zkscan4Q5SZT6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Zkscan4Q5SZT6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Zkscan4Q5SZT6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Zkscan4Q5SZT6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Zkscan4Q5SZT6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Zkscan4Q5SZT6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Zkscan4Q5SZT6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Zkscan4Q5SZT6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Zkscan4Q5SZT6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Zkscan4Q5SZT6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Zkscan4Q5SZT6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Zkscan4Q5SZT6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,66■■■□□ 2,18
Zkscan4Q5SZT6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Zkscan4Q5SZT6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Zkscan4Q5SZT6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Zkscan4Q5SZT6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Zkscan4Q5SZT6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Zkscan4Q5SZT6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Zkscan4Q5SZT6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Zkscan4Q5SZT6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28,63■■■□□ 2,17
Zkscan4Q5SZT6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Zkscan4Q5SZT6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Zkscan4Q5SZT6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Zkscan4Q5SZT6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Zkscan4Q5SZT6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Zkscan4Q5SZT6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Zkscan4Q5SZT6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Zkscan4Q5SZT6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Zkscan4Q5SZT6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Zkscan4Q5SZT6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Zkscan4Q5SZT6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Zkscan4Q5SZT6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Zkscan4Q5SZT6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,16
Zkscan4Q5SZT6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Zkscan4Q5SZT6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Zkscan4Q5SZT6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Zkscan4Q5SZT6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Zkscan4Q5SZT6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,49■■■□□ 2,15
Zkscan4Q5SZT6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Zkscan4Q5SZT6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Zkscan4Q5SZT6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Zkscan4Q5SZT6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Zkscan4Q5SZT6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,15
Zkscan4Q5SZT6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Zkscan4Q5SZT6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Zkscan4Q5SZT6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Zkscan4Q5SZT6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Zkscan4Q5SZT6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Zkscan4Q5SZT6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Zkscan4Q5SZT6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Zkscan4Q5SZT6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Zkscan4Q5SZT6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Zkscan4Q5SZT6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Zkscan4Q5SZT6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Zkscan4Q5SZT6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Zkscan4Q5SZT6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Zkscan4Q5SZT6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Zkscan4Q5SZT6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Zkscan4Q5SZT6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28,3■■■□□ 2,12
Zkscan4Q5SZT6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Zkscan4Q5SZT6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Zkscan4Q5SZT6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Zkscan4Q5SZT6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Zkscan4Q5SZT6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Zkscan4Q5SZT6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Zkscan4Q5SZT6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Zkscan4Q5SZT6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Zkscan4Q5SZT6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Zkscan4Q5SZT6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Zkscan4Q5SZT6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Zkscan4Q5SZT6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Zkscan4Q5SZT6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Zkscan4Q5SZT6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Zkscan4Q5SZT6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Zkscan4Q5SZT6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Zkscan4Q5SZT6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Zkscan4Q5SZT6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28,09■■■□□ 2,09
Zkscan4Q5SZT6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Zkscan4Q5SZT6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Zkscan4Q5SZT6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Zkscan4Q5SZT6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Zkscan4Q5SZT6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Zkscan4Q5SZT6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Zkscan4Q5SZT6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Zkscan4Q5SZT6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms