Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Tsr1Q5SWD9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tsr1Q5SWD9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tsr1Q5SWD9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tsr1Q5SWD9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tsr1Q5SWD9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tsr1Q5SWD9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tsr1Q5SWD9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tsr1Q5SWD9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tsr1Q5SWD9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tsr1Q5SWD9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Tsr1Q5SWD9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tsr1Q5SWD9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tsr1Q5SWD9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tsr1Q5SWD9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tsr1Q5SWD9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tsr1Q5SWD9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tsr1Q5SWD9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tsr1Q5SWD9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tsr1Q5SWD9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tsr1Q5SWD9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tsr1Q5SWD9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tsr1Q5SWD9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tsr1Q5SWD9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tsr1Q5SWD9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tsr1Q5SWD9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tsr1Q5SWD9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tsr1Q5SWD9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tsr1Q5SWD9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tsr1Q5SWD9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tsr1Q5SWD9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tsr1Q5SWD9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tsr1Q5SWD9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Tsr1Q5SWD9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tsr1Q5SWD9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Tsr1Q5SWD9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tsr1Q5SWD9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tsr1Q5SWD9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tsr1Q5SWD9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tsr1Q5SWD9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tsr1Q5SWD9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tsr1Q5SWD9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tsr1Q5SWD9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tsr1Q5SWD9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tsr1Q5SWD9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Tsr1Q5SWD9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tsr1Q5SWD9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tsr1Q5SWD9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tsr1Q5SWD9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tsr1Q5SWD9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tsr1Q5SWD9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tsr1Q5SWD9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tsr1Q5SWD9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tsr1Q5SWD9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tsr1Q5SWD9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tsr1Q5SWD9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tsr1Q5SWD9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tsr1Q5SWD9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Tsr1Q5SWD9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tsr1Q5SWD9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tsr1Q5SWD9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tsr1Q5SWD9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tsr1Q5SWD9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tsr1Q5SWD9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tsr1Q5SWD9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tsr1Q5SWD9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tsr1Q5SWD9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tsr1Q5SWD9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tsr1Q5SWD9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Tsr1Q5SWD9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tsr1Q5SWD9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tsr1Q5SWD9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tsr1Q5SWD9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tsr1Q5SWD9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tsr1Q5SWD9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tsr1Q5SWD9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tsr1Q5SWD9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tsr1Q5SWD9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tsr1Q5SWD9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tsr1Q5SWD9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tsr1Q5SWD9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tsr1Q5SWD9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tsr1Q5SWD9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Tsr1Q5SWD9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tsr1Q5SWD9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tsr1Q5SWD9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tsr1Q5SWD9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tsr1Q5SWD9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Tsr1Q5SWD9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tsr1Q5SWD9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tsr1Q5SWD9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tsr1Q5SWD9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tsr1Q5SWD9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tsr1Q5SWD9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tsr1Q5SWD9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tsr1Q5SWD9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Tsr1Q5SWD9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms