Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI2

Slc44a5, Choline transporter-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a5Q5RJI2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc44a5Q5RJI2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc44a5Q5RJI2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc44a5Q5RJI2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc44a5Q5RJI2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc44a5Q5RJI2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc44a5Q5RJI2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc44a5Q5RJI2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc44a5Q5RJI2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc44a5Q5RJI2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc44a5Q5RJI2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc44a5Q5RJI2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc44a5Q5RJI2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc44a5Q5RJI2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc44a5Q5RJI2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc44a5Q5RJI2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc44a5Q5RJI2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc44a5Q5RJI2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc44a5Q5RJI2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc44a5Q5RJI2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc44a5Q5RJI2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc44a5Q5RJI2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc44a5Q5RJI2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc44a5Q5RJI2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc44a5Q5RJI2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc44a5Q5RJI2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc44a5Q5RJI2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc44a5Q5RJI2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc44a5Q5RJI2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc44a5Q5RJI2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc44a5Q5RJI2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc44a5Q5RJI2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc44a5Q5RJI2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc44a5Q5RJI2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc44a5Q5RJI2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc44a5Q5RJI2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc44a5Q5RJI2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc44a5Q5RJI2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc44a5Q5RJI2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc44a5Q5RJI2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc44a5Q5RJI2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc44a5Q5RJI2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc44a5Q5RJI2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc44a5Q5RJI2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc44a5Q5RJI2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc44a5Q5RJI2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc44a5Q5RJI2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc44a5Q5RJI2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc44a5Q5RJI2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc44a5Q5RJI2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc44a5Q5RJI2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc44a5Q5RJI2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc44a5Q5RJI2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc44a5Q5RJI2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc44a5Q5RJI2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc44a5Q5RJI2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc44a5Q5RJI2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc44a5Q5RJI2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc44a5Q5RJI2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc44a5Q5RJI2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc44a5Q5RJI2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc44a5Q5RJI2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc44a5Q5RJI2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc44a5Q5RJI2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc44a5Q5RJI2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc44a5Q5RJI2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc44a5Q5RJI2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc44a5Q5RJI2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc44a5Q5RJI2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc44a5Q5RJI2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc44a5Q5RJI2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc44a5Q5RJI2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc44a5Q5RJI2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a5Q5RJI2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc44a5Q5RJI2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc44a5Q5RJI2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc44a5Q5RJI2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc44a5Q5RJI2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc44a5Q5RJI2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc44a5Q5RJI2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc44a5Q5RJI2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc44a5Q5RJI2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc44a5Q5RJI2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc44a5Q5RJI2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc44a5Q5RJI2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc44a5Q5RJI2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc44a5Q5RJI2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc44a5Q5RJI2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc44a5Q5RJI2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc44a5Q5RJI2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc44a5Q5RJI2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc44a5Q5RJI2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc44a5Q5RJI2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc44a5Q5RJI2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc44a5Q5RJI2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc44a5Q5RJI2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc44a5Q5RJI2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc44a5Q5RJI2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc44a5Q5RJI2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc44a5Q5RJI2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms