Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gm5431Q5NCB3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm5431Q5NCB3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm5431Q5NCB3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm5431Q5NCB3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm5431Q5NCB3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm5431Q5NCB3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm5431Q5NCB3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm5431Q5NCB3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm5431Q5NCB3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5431Q5NCB3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm5431Q5NCB3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm5431Q5NCB3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm5431Q5NCB3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm5431Q5NCB3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm5431Q5NCB3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm5431Q5NCB3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm5431Q5NCB3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5431Q5NCB3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5431Q5NCB3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm5431Q5NCB3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm5431Q5NCB3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm5431Q5NCB3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm5431Q5NCB3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm5431Q5NCB3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm5431Q5NCB3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm5431Q5NCB3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm5431Q5NCB3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm5431Q5NCB3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm5431Q5NCB3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm5431Q5NCB3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm5431Q5NCB3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm5431Q5NCB3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gm5431Q5NCB3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm5431Q5NCB3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm5431Q5NCB3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm5431Q5NCB3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm5431Q5NCB3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm5431Q5NCB3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm5431Q5NCB3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm5431Q5NCB3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm5431Q5NCB3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm5431Q5NCB3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm5431Q5NCB3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm5431Q5NCB3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm5431Q5NCB3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm5431Q5NCB3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm5431Q5NCB3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm5431Q5NCB3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm5431Q5NCB3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm5431Q5NCB3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm5431Q5NCB3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm5431Q5NCB3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm5431Q5NCB3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm5431Q5NCB3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm5431Q5NCB3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm5431Q5NCB3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm5431Q5NCB3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm5431Q5NCB3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm5431Q5NCB3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm5431Q5NCB3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm5431Q5NCB3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm5431Q5NCB3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm5431Q5NCB3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm5431Q5NCB3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm5431Q5NCB3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm5431Q5NCB3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm5431Q5NCB3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm5431Q5NCB3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm5431Q5NCB3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm5431Q5NCB3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm5431Q5NCB3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm5431Q5NCB3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm5431Q5NCB3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm5431Q5NCB3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm5431Q5NCB3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm5431Q5NCB3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm5431Q5NCB3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm5431Q5NCB3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm5431Q5NCB3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm5431Q5NCB3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm5431Q5NCB3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm5431Q5NCB3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm5431Q5NCB3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm5431Q5NCB3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm5431Q5NCB3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm5431Q5NCB3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5431Q5NCB3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm5431Q5NCB3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm5431Q5NCB3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm5431Q5NCB3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm5431Q5NCB3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm5431Q5NCB3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm5431Q5NCB3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm5431Q5NCB3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm5431Q5NCB3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm5431Q5NCB3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm5431Q5NCB3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm5431Q5NCB3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm5431Q5NCB3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms