Protein–RNA interactions for Protein: Q501J7

Phactr4, Phosphatase and actin regulator 4, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr4Q501J7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Phactr4Q501J7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Phactr4Q501J7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Phactr4Q501J7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Phactr4Q501J7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Phactr4Q501J7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Phactr4Q501J7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Phactr4Q501J7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Phactr4Q501J7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Phactr4Q501J7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Phactr4Q501J7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Phactr4Q501J7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Phactr4Q501J7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Phactr4Q501J7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Phactr4Q501J7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Phactr4Q501J7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Phactr4Q501J7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Phactr4Q501J7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Phactr4Q501J7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Phactr4Q501J7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Phactr4Q501J7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Phactr4Q501J7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Phactr4Q501J7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Phactr4Q501J7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Phactr4Q501J7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Phactr4Q501J7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Phactr4Q501J7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Phactr4Q501J7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Phactr4Q501J7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Phactr4Q501J7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Phactr4Q501J7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Phactr4Q501J7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Phactr4Q501J7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Phactr4Q501J7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Phactr4Q501J7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Phactr4Q501J7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Phactr4Q501J7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Phactr4Q501J7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Phactr4Q501J7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Phactr4Q501J7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Phactr4Q501J7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Phactr4Q501J7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Phactr4Q501J7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Phactr4Q501J7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Phactr4Q501J7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Phactr4Q501J7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Phactr4Q501J7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Phactr4Q501J7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Phactr4Q501J7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Phactr4Q501J7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Phactr4Q501J7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Phactr4Q501J7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Phactr4Q501J7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Phactr4Q501J7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Phactr4Q501J7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Phactr4Q501J7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Phactr4Q501J7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Phactr4Q501J7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Phactr4Q501J7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Phactr4Q501J7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Phactr4Q501J7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Phactr4Q501J7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Phactr4Q501J7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Phactr4Q501J7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Phactr4Q501J7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Phactr4Q501J7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Phactr4Q501J7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Phactr4Q501J7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Phactr4Q501J7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Phactr4Q501J7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Phactr4Q501J7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Phactr4Q501J7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Phactr4Q501J7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Phactr4Q501J7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Phactr4Q501J7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Phactr4Q501J7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Phactr4Q501J7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Phactr4Q501J7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Phactr4Q501J7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Phactr4Q501J7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Phactr4Q501J7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Phactr4Q501J7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Phactr4Q501J7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Phactr4Q501J7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Phactr4Q501J7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Phactr4Q501J7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Phactr4Q501J7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Phactr4Q501J7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Phactr4Q501J7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Phactr4Q501J7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Phactr4Q501J7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Phactr4Q501J7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Phactr4Q501J7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Phactr4Q501J7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Phactr4Q501J7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Phactr4Q501J7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Phactr4Q501J7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Phactr4Q501J7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Phactr4Q501J7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Phactr4Q501J7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms