Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam220aQ3ZN08 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fam220aQ3ZN08 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fam220aQ3ZN08 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam220aQ3ZN08 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam220aQ3ZN08 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam220aQ3ZN08 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam220aQ3ZN08 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam220aQ3ZN08 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam220aQ3ZN08 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam220aQ3ZN08 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam220aQ3ZN08 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam220aQ3ZN08 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam220aQ3ZN08 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam220aQ3ZN08 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam220aQ3ZN08 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam220aQ3ZN08 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam220aQ3ZN08 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam220aQ3ZN08 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam220aQ3ZN08 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam220aQ3ZN08 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam220aQ3ZN08 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam220aQ3ZN08 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam220aQ3ZN08 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam220aQ3ZN08 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam220aQ3ZN08 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam220aQ3ZN08 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam220aQ3ZN08 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam220aQ3ZN08 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam220aQ3ZN08 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam220aQ3ZN08 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam220aQ3ZN08 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam220aQ3ZN08 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam220aQ3ZN08 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam220aQ3ZN08 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam220aQ3ZN08 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam220aQ3ZN08 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam220aQ3ZN08 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam220aQ3ZN08 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam220aQ3ZN08 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam220aQ3ZN08 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fam220aQ3ZN08 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam220aQ3ZN08 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam220aQ3ZN08 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam220aQ3ZN08 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam220aQ3ZN08 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam220aQ3ZN08 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam220aQ3ZN08 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam220aQ3ZN08 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam220aQ3ZN08 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam220aQ3ZN08 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam220aQ3ZN08 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam220aQ3ZN08 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam220aQ3ZN08 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam220aQ3ZN08 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam220aQ3ZN08 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam220aQ3ZN08 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam220aQ3ZN08 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam220aQ3ZN08 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam220aQ3ZN08 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam220aQ3ZN08 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam220aQ3ZN08 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam220aQ3ZN08 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam220aQ3ZN08 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam220aQ3ZN08 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam220aQ3ZN08 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam220aQ3ZN08 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam220aQ3ZN08 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam220aQ3ZN08 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam220aQ3ZN08 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam220aQ3ZN08 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam220aQ3ZN08 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam220aQ3ZN08 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam220aQ3ZN08 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam220aQ3ZN08 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam220aQ3ZN08 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam220aQ3ZN08 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam220aQ3ZN08 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam220aQ3ZN08 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam220aQ3ZN08 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam220aQ3ZN08 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam220aQ3ZN08 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam220aQ3ZN08 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam220aQ3ZN08 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam220aQ3ZN08 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms