Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim26Q3V460 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim26Q3V460 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim26Q3V460 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim26Q3V460 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim26Q3V460 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim26Q3V460 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim26Q3V460 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim26Q3V460 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim26Q3V460 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim26Q3V460 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim26Q3V460 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim26Q3V460 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim26Q3V460 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim26Q3V460 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim26Q3V460 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim26Q3V460 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim26Q3V460 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim26Q3V460 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim26Q3V460 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim26Q3V460 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim26Q3V460 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim26Q3V460 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim26Q3V460 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim26Q3V460 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim26Q3V460 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim26Q3V460 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim26Q3V460 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim26Q3V460 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim26Q3V460 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim26Q3V460 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim26Q3V460 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim26Q3V460 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim26Q3V460 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim26Q3V460 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim26Q3V460 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim26Q3V460 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim26Q3V460 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim26Q3V460 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim26Q3V460 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim26Q3V460 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim26Q3V460 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim26Q3V460 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim26Q3V460 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim26Q3V460 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim26Q3V460 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim26Q3V460 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim26Q3V460 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim26Q3V460 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim26Q3V460 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim26Q3V460 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim26Q3V460 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim26Q3V460 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim26Q3V460 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim26Q3V460 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim26Q3V460 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim26Q3V460 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim26Q3V460 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim26Q3V460 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim26Q3V460 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim26Q3V460 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim26Q3V460 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim26Q3V460 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim26Q3V460 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim26Q3V460 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim26Q3V460 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim26Q3V460 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim26Q3V460 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim26Q3V460 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim26Q3V460 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim26Q3V460 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim26Q3V460 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim26Q3V460 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim26Q3V460 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim26Q3V460 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim26Q3V460 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim26Q3V460 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim26Q3V460 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim26Q3V460 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim26Q3V460 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim26Q3V460 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim26Q3V460 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim26Q3V460 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim26Q3V460 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim26Q3V460 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim26Q3V460 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim26Q3V460 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim26Q3V460 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim26Q3V460 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim26Q3V460 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim26Q3V460 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim26Q3V460 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim26Q3V460 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim26Q3V460 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim26Q3V460 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim26Q3V460 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim26Q3V460 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim26Q3V460 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim26Q3V460 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim26Q3V460 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms