Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cldn34b4Q3V0X2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cldn34b4Q3V0X2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cldn34b4Q3V0X2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cldn34b4Q3V0X2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cldn34b4Q3V0X2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cldn34b4Q3V0X2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cldn34b4Q3V0X2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cldn34b4Q3V0X2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cldn34b4Q3V0X2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cldn34b4Q3V0X2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cldn34b4Q3V0X2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cldn34b4Q3V0X2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cldn34b4Q3V0X2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cldn34b4Q3V0X2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cldn34b4Q3V0X2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cldn34b4Q3V0X2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cldn34b4Q3V0X2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cldn34b4Q3V0X2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cldn34b4Q3V0X2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cldn34b4Q3V0X2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cldn34b4Q3V0X2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cldn34b4Q3V0X2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cldn34b4Q3V0X2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cldn34b4Q3V0X2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cldn34b4Q3V0X2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cldn34b4Q3V0X2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cldn34b4Q3V0X2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cldn34b4Q3V0X2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cldn34b4Q3V0X2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cldn34b4Q3V0X2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cldn34b4Q3V0X2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cldn34b4Q3V0X2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cldn34b4Q3V0X2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cldn34b4Q3V0X2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cldn34b4Q3V0X2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cldn34b4Q3V0X2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cldn34b4Q3V0X2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cldn34b4Q3V0X2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cldn34b4Q3V0X2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cldn34b4Q3V0X2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cldn34b4Q3V0X2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cldn34b4Q3V0X2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cldn34b4Q3V0X2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cldn34b4Q3V0X2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cldn34b4Q3V0X2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cldn34b4Q3V0X2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cldn34b4Q3V0X2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cldn34b4Q3V0X2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cldn34b4Q3V0X2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cldn34b4Q3V0X2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cldn34b4Q3V0X2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cldn34b4Q3V0X2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cldn34b4Q3V0X2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cldn34b4Q3V0X2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cldn34b4Q3V0X2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cldn34b4Q3V0X2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cldn34b4Q3V0X2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cldn34b4Q3V0X2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cldn34b4Q3V0X2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cldn34b4Q3V0X2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cldn34b4Q3V0X2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cldn34b4Q3V0X2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldn34b4Q3V0X2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cldn34b4Q3V0X2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cldn34b4Q3V0X2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cldn34b4Q3V0X2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cldn34b4Q3V0X2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cldn34b4Q3V0X2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cldn34b4Q3V0X2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cldn34b4Q3V0X2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cldn34b4Q3V0X2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cldn34b4Q3V0X2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cldn34b4Q3V0X2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cldn34b4Q3V0X2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cldn34b4Q3V0X2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cldn34b4Q3V0X2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cldn34b4Q3V0X2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cldn34b4Q3V0X2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cldn34b4Q3V0X2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cldn34b4Q3V0X2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn34b4Q3V0X2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn34b4Q3V0X2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cldn34b4Q3V0X2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cldn34b4Q3V0X2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cldn34b4Q3V0X2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cldn34b4Q3V0X2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn34b4Q3V0X2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cldn34b4Q3V0X2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cldn34b4Q3V0X2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn34b4Q3V0X2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn34b4Q3V0X2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn34b4Q3V0X2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms