Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0T4

Itgad, Integrin alpha-D, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgadQ3V0T4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ItgadQ3V0T4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ItgadQ3V0T4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ItgadQ3V0T4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ItgadQ3V0T4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ItgadQ3V0T4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ItgadQ3V0T4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ItgadQ3V0T4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ItgadQ3V0T4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ItgadQ3V0T4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ItgadQ3V0T4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ItgadQ3V0T4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ItgadQ3V0T4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ItgadQ3V0T4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ItgadQ3V0T4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ItgadQ3V0T4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ItgadQ3V0T4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ItgadQ3V0T4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ItgadQ3V0T4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ItgadQ3V0T4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ItgadQ3V0T4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ItgadQ3V0T4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ItgadQ3V0T4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ItgadQ3V0T4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ItgadQ3V0T4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ItgadQ3V0T4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ItgadQ3V0T4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ItgadQ3V0T4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ItgadQ3V0T4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ItgadQ3V0T4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ItgadQ3V0T4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ItgadQ3V0T4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ItgadQ3V0T4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ItgadQ3V0T4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ItgadQ3V0T4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ItgadQ3V0T4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ItgadQ3V0T4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ItgadQ3V0T4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ItgadQ3V0T4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ItgadQ3V0T4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ItgadQ3V0T4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ItgadQ3V0T4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ItgadQ3V0T4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ItgadQ3V0T4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ItgadQ3V0T4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ItgadQ3V0T4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ItgadQ3V0T4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ItgadQ3V0T4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ItgadQ3V0T4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ItgadQ3V0T4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ItgadQ3V0T4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ItgadQ3V0T4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ItgadQ3V0T4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ItgadQ3V0T4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ItgadQ3V0T4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ItgadQ3V0T4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ItgadQ3V0T4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ItgadQ3V0T4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ItgadQ3V0T4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ItgadQ3V0T4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ItgadQ3V0T4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ItgadQ3V0T4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ItgadQ3V0T4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ItgadQ3V0T4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ItgadQ3V0T4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ItgadQ3V0T4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ItgadQ3V0T4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ItgadQ3V0T4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ItgadQ3V0T4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ItgadQ3V0T4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ItgadQ3V0T4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ItgadQ3V0T4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ItgadQ3V0T4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ItgadQ3V0T4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ItgadQ3V0T4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ItgadQ3V0T4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ItgadQ3V0T4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ItgadQ3V0T4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ItgadQ3V0T4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ItgadQ3V0T4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ItgadQ3V0T4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ItgadQ3V0T4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ItgadQ3V0T4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ItgadQ3V0T4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ItgadQ3V0T4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ItgadQ3V0T4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ItgadQ3V0T4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ItgadQ3V0T4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ItgadQ3V0T4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ItgadQ3V0T4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ItgadQ3V0T4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ItgadQ3V0T4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ItgadQ3V0T4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ItgadQ3V0T4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ItgadQ3V0T4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ItgadQ3V0T4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ItgadQ3V0T4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ItgadQ3V0T4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ItgadQ3V0T4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ItgadQ3V0T4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms