Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Bbof1Q3V079 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Bbof1Q3V079 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Bbof1Q3V079 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Bbof1Q3V079 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Bbof1Q3V079 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Bbof1Q3V079 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Bbof1Q3V079 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Bbof1Q3V079 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Bbof1Q3V079 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Bbof1Q3V079 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Bbof1Q3V079 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Bbof1Q3V079 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Bbof1Q3V079 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Bbof1Q3V079 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Bbof1Q3V079 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Bbof1Q3V079 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Bbof1Q3V079 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Bbof1Q3V079 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Bbof1Q3V079 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Bbof1Q3V079 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Bbof1Q3V079 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Bbof1Q3V079 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Bbof1Q3V079 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Bbof1Q3V079 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Bbof1Q3V079 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Bbof1Q3V079 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Bbof1Q3V079 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Bbof1Q3V079 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Bbof1Q3V079 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Bbof1Q3V079 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Bbof1Q3V079 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Bbof1Q3V079 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Bbof1Q3V079 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Bbof1Q3V079 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bbof1Q3V079 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Bbof1Q3V079 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Bbof1Q3V079 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Bbof1Q3V079 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Bbof1Q3V079 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Bbof1Q3V079 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Bbof1Q3V079 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Bbof1Q3V079 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Bbof1Q3V079 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Bbof1Q3V079 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Bbof1Q3V079 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bbof1Q3V079 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Bbof1Q3V079 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bbof1Q3V079 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bbof1Q3V079 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Bbof1Q3V079 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Bbof1Q3V079 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Bbof1Q3V079 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Bbof1Q3V079 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Bbof1Q3V079 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Bbof1Q3V079 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Bbof1Q3V079 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Bbof1Q3V079 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bbof1Q3V079 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bbof1Q3V079 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bbof1Q3V079 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Bbof1Q3V079 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Bbof1Q3V079 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Bbof1Q3V079 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Bbof1Q3V079 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bbof1Q3V079 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bbof1Q3V079 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bbof1Q3V079 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bbof1Q3V079 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bbof1Q3V079 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bbof1Q3V079 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Bbof1Q3V079 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Bbof1Q3V079 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Bbof1Q3V079 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Bbof1Q3V079 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Bbof1Q3V079 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Bbof1Q3V079 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bbof1Q3V079 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bbof1Q3V079 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bbof1Q3V079 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bbof1Q3V079 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bbof1Q3V079 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bbof1Q3V079 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bbof1Q3V079 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bbof1Q3V079 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Bbof1Q3V079 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bbof1Q3V079 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bbof1Q3V079 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Bbof1Q3V079 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Bbof1Q3V079 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Bbof1Q3V079 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Bbof1Q3V079 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Bbof1Q3V079 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bbof1Q3V079 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bbof1Q3V079 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bbof1Q3V079 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Bbof1Q3V079 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bbof1Q3V079 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bbof1Q3V079 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bbof1Q3V079 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms