Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nr1d1Q3UV55 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nr1d1Q3UV55 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Nr1d1Q3UV55 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nr1d1Q3UV55 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Nr1d1Q3UV55 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nr1d1Q3UV55 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nr1d1Q3UV55 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nr1d1Q3UV55 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nr1d1Q3UV55 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nr1d1Q3UV55 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nr1d1Q3UV55 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nr1d1Q3UV55 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nr1d1Q3UV55 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nr1d1Q3UV55 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nr1d1Q3UV55 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nr1d1Q3UV55 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nr1d1Q3UV55 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nr1d1Q3UV55 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nr1d1Q3UV55 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nr1d1Q3UV55 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nr1d1Q3UV55 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nr1d1Q3UV55 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Nr1d1Q3UV55 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nr1d1Q3UV55 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nr1d1Q3UV55 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nr1d1Q3UV55 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nr1d1Q3UV55 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nr1d1Q3UV55 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nr1d1Q3UV55 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nr1d1Q3UV55 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nr1d1Q3UV55 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nr1d1Q3UV55 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nr1d1Q3UV55 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nr1d1Q3UV55 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nr1d1Q3UV55 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nr1d1Q3UV55 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nr1d1Q3UV55 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nr1d1Q3UV55 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nr1d1Q3UV55 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nr1d1Q3UV55 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nr1d1Q3UV55 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nr1d1Q3UV55 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Nr1d1Q3UV55 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nr1d1Q3UV55 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nr1d1Q3UV55 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nr1d1Q3UV55 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nr1d1Q3UV55 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nr1d1Q3UV55 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nr1d1Q3UV55 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nr1d1Q3UV55 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nr1d1Q3UV55 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nr1d1Q3UV55 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nr1d1Q3UV55 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nr1d1Q3UV55 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Nr1d1Q3UV55 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Nr1d1Q3UV55 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nr1d1Q3UV55 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nr1d1Q3UV55 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nr1d1Q3UV55 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nr1d1Q3UV55 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nr1d1Q3UV55 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nr1d1Q3UV55 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nr1d1Q3UV55 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nr1d1Q3UV55 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nr1d1Q3UV55 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nr1d1Q3UV55 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nr1d1Q3UV55 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nr1d1Q3UV55 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nr1d1Q3UV55 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nr1d1Q3UV55 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nr1d1Q3UV55 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nr1d1Q3UV55 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nr1d1Q3UV55 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nr1d1Q3UV55 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nr1d1Q3UV55 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nr1d1Q3UV55 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nr1d1Q3UV55 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nr1d1Q3UV55 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nr1d1Q3UV55 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nr1d1Q3UV55 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nr1d1Q3UV55 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nr1d1Q3UV55 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nr1d1Q3UV55 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nr1d1Q3UV55 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nr1d1Q3UV55 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nr1d1Q3UV55 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nr1d1Q3UV55 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nr1d1Q3UV55 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nr1d1Q3UV55 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nr1d1Q3UV55 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nr1d1Q3UV55 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Nr1d1Q3UV55 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nr1d1Q3UV55 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nr1d1Q3UV55 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nr1d1Q3UV55 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nr1d1Q3UV55 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nr1d1Q3UV55 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nr1d1Q3UV55 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nr1d1Q3UV55 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms