Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm29609Q3UU56 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Gm29609Q3UU56 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm29609Q3UU56 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Gm29609Q3UU56 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Gm29609Q3UU56 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm29609Q3UU56 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm29609Q3UU56 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm29609Q3UU56 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm29609Q3UU56 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm29609Q3UU56 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm29609Q3UU56 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm29609Q3UU56 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm29609Q3UU56 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm29609Q3UU56 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm29609Q3UU56 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm29609Q3UU56 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm29609Q3UU56 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm29609Q3UU56 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm29609Q3UU56 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm29609Q3UU56 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm29609Q3UU56 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm29609Q3UU56 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm29609Q3UU56 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm29609Q3UU56 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm29609Q3UU56 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm29609Q3UU56 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm29609Q3UU56 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm29609Q3UU56 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm29609Q3UU56 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm29609Q3UU56 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Gm29609Q3UU56 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm29609Q3UU56 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm29609Q3UU56 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gm29609Q3UU56 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gm29609Q3UU56 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gm29609Q3UU56 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm29609Q3UU56 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm29609Q3UU56 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm29609Q3UU56 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm29609Q3UU56 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm29609Q3UU56 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm29609Q3UU56 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm29609Q3UU56 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gm29609Q3UU56 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gm29609Q3UU56 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm29609Q3UU56 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm29609Q3UU56 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm29609Q3UU56 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm29609Q3UU56 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gm29609Q3UU56 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gm29609Q3UU56 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gm29609Q3UU56 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm29609Q3UU56 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm29609Q3UU56 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm29609Q3UU56 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm29609Q3UU56 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm29609Q3UU56 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gm29609Q3UU56 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gm29609Q3UU56 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm29609Q3UU56 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm29609Q3UU56 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm29609Q3UU56 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm29609Q3UU56 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm29609Q3UU56 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm29609Q3UU56 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm29609Q3UU56 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm29609Q3UU56 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gm29609Q3UU56 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gm29609Q3UU56 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm29609Q3UU56 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm29609Q3UU56 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm29609Q3UU56 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm29609Q3UU56 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm29609Q3UU56 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Gm29609Q3UU56 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm29609Q3UU56 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm29609Q3UU56 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm29609Q3UU56 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm29609Q3UU56 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm29609Q3UU56 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm29609Q3UU56 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm29609Q3UU56 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm29609Q3UU56 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm29609Q3UU56 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm29609Q3UU56 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm29609Q3UU56 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm29609Q3UU56 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm29609Q3UU56 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm29609Q3UU56 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm29609Q3UU56 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm29609Q3UU56 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm29609Q3UU56 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm29609Q3UU56 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm29609Q3UU56 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm29609Q3UU56 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm29609Q3UU56 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm29609Q3UU56 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm29609Q3UU56 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm29609Q3UU56 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.9 ms