Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
D13Ertd608eQ3UPR8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
D13Ertd608eQ3UPR8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
D13Ertd608eQ3UPR8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
D13Ertd608eQ3UPR8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
D13Ertd608eQ3UPR8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms