Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrc1Q3UPH1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prrc1Q3UPH1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prrc1Q3UPH1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrc1Q3UPH1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrc1Q3UPH1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrc1Q3UPH1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrc1Q3UPH1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrc1Q3UPH1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrc1Q3UPH1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrc1Q3UPH1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrc1Q3UPH1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrc1Q3UPH1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrc1Q3UPH1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrc1Q3UPH1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrc1Q3UPH1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrc1Q3UPH1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrc1Q3UPH1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrc1Q3UPH1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrc1Q3UPH1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prrc1Q3UPH1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prrc1Q3UPH1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrc1Q3UPH1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrc1Q3UPH1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrc1Q3UPH1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prrc1Q3UPH1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Prrc1Q3UPH1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrc1Q3UPH1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrc1Q3UPH1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrc1Q3UPH1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrc1Q3UPH1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrc1Q3UPH1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prrc1Q3UPH1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prrc1Q3UPH1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrc1Q3UPH1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrc1Q3UPH1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrc1Q3UPH1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrc1Q3UPH1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrc1Q3UPH1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrc1Q3UPH1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrc1Q3UPH1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrc1Q3UPH1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrc1Q3UPH1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrc1Q3UPH1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrc1Q3UPH1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prrc1Q3UPH1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prrc1Q3UPH1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc1Q3UPH1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc1Q3UPH1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc1Q3UPH1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc1Q3UPH1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrc1Q3UPH1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrc1Q3UPH1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrc1Q3UPH1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrc1Q3UPH1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrc1Q3UPH1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrc1Q3UPH1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrc1Q3UPH1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrc1Q3UPH1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prrc1Q3UPH1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prrc1Q3UPH1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Prrc1Q3UPH1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrc1Q3UPH1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrc1Q3UPH1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrc1Q3UPH1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrc1Q3UPH1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrc1Q3UPH1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrc1Q3UPH1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrc1Q3UPH1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrc1Q3UPH1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrc1Q3UPH1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrc1Q3UPH1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrc1Q3UPH1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrc1Q3UPH1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrc1Q3UPH1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrc1Q3UPH1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrc1Q3UPH1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prrc1Q3UPH1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Prrc1Q3UPH1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prrc1Q3UPH1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prrc1Q3UPH1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prrc1Q3UPH1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prrc1Q3UPH1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prrc1Q3UPH1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prrc1Q3UPH1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prrc1Q3UPH1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prrc1Q3UPH1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prrc1Q3UPH1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prrc1Q3UPH1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prrc1Q3UPH1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prrc1Q3UPH1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prrc1Q3UPH1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prrc1Q3UPH1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prrc1Q3UPH1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prrc1Q3UPH1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prrc1Q3UPH1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Prrc1Q3UPH1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prrc1Q3UPH1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prrc1Q3UPH1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prrc1Q3UPH1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms