Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnft2Q3UF64 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnft2Q3UF64 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnft2Q3UF64 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnft2Q3UF64 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnft2Q3UF64 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnft2Q3UF64 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnft2Q3UF64 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnft2Q3UF64 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnft2Q3UF64 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnft2Q3UF64 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnft2Q3UF64 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnft2Q3UF64 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnft2Q3UF64 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnft2Q3UF64 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnft2Q3UF64 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnft2Q3UF64 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnft2Q3UF64 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnft2Q3UF64 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnft2Q3UF64 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnft2Q3UF64 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnft2Q3UF64 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnft2Q3UF64 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnft2Q3UF64 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnft2Q3UF64 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnft2Q3UF64 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnft2Q3UF64 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnft2Q3UF64 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnft2Q3UF64 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnft2Q3UF64 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnft2Q3UF64 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnft2Q3UF64 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnft2Q3UF64 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnft2Q3UF64 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnft2Q3UF64 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnft2Q3UF64 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnft2Q3UF64 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnft2Q3UF64 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnft2Q3UF64 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnft2Q3UF64 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnft2Q3UF64 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnft2Q3UF64 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnft2Q3UF64 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnft2Q3UF64 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnft2Q3UF64 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnft2Q3UF64 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnft2Q3UF64 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnft2Q3UF64 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnft2Q3UF64 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnft2Q3UF64 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnft2Q3UF64 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnft2Q3UF64 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnft2Q3UF64 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnft2Q3UF64 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnft2Q3UF64 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnft2Q3UF64 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnft2Q3UF64 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnft2Q3UF64 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnft2Q3UF64 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnft2Q3UF64 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnft2Q3UF64 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnft2Q3UF64 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnft2Q3UF64 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnft2Q3UF64 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnft2Q3UF64 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnft2Q3UF64 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnft2Q3UF64 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnft2Q3UF64 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnft2Q3UF64 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnft2Q3UF64 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnft2Q3UF64 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnft2Q3UF64 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnft2Q3UF64 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnft2Q3UF64 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnft2Q3UF64 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnft2Q3UF64 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnft2Q3UF64 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnft2Q3UF64 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnft2Q3UF64 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnft2Q3UF64 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnft2Q3UF64 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnft2Q3UF64 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnft2Q3UF64 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnft2Q3UF64 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnft2Q3UF64 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnft2Q3UF64 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnft2Q3UF64 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnft2Q3UF64 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnft2Q3UF64 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnft2Q3UF64 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnft2Q3UF64 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnft2Q3UF64 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnft2Q3UF64 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnft2Q3UF64 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnft2Q3UF64 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnft2Q3UF64 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnft2Q3UF64 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnft2Q3UF64 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnft2Q3UF64 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnft2Q3UF64 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms