Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Gse1Q3U3C9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gse1Q3U3C9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gse1Q3U3C9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gse1Q3U3C9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gse1Q3U3C9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gse1Q3U3C9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gse1Q3U3C9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gse1Q3U3C9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gse1Q3U3C9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Gse1Q3U3C9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Gse1Q3U3C9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gse1Q3U3C9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gse1Q3U3C9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gse1Q3U3C9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Gse1Q3U3C9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gse1Q3U3C9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Gse1Q3U3C9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gse1Q3U3C9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Gse1Q3U3C9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gse1Q3U3C9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gse1Q3U3C9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gse1Q3U3C9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gse1Q3U3C9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gse1Q3U3C9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gse1Q3U3C9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gse1Q3U3C9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Gse1Q3U3C9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gse1Q3U3C9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gse1Q3U3C9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gse1Q3U3C9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gse1Q3U3C9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gse1Q3U3C9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gse1Q3U3C9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Gse1Q3U3C9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gse1Q3U3C9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gse1Q3U3C9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gse1Q3U3C9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gse1Q3U3C9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gse1Q3U3C9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gse1Q3U3C9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gse1Q3U3C9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gse1Q3U3C9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Gse1Q3U3C9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gse1Q3U3C9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gse1Q3U3C9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gse1Q3U3C9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gse1Q3U3C9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gse1Q3U3C9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gse1Q3U3C9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gse1Q3U3C9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gse1Q3U3C9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gse1Q3U3C9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gse1Q3U3C9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gse1Q3U3C9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gse1Q3U3C9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gse1Q3U3C9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gse1Q3U3C9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gse1Q3U3C9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gse1Q3U3C9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gse1Q3U3C9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gse1Q3U3C9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gse1Q3U3C9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Gse1Q3U3C9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Gse1Q3U3C9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gse1Q3U3C9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gse1Q3U3C9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Gse1Q3U3C9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gse1Q3U3C9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gse1Q3U3C9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gse1Q3U3C9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gse1Q3U3C9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gse1Q3U3C9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Gse1Q3U3C9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gse1Q3U3C9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gse1Q3U3C9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gse1Q3U3C9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gse1Q3U3C9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gse1Q3U3C9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gse1Q3U3C9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gse1Q3U3C9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gse1Q3U3C9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gse1Q3U3C9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gse1Q3U3C9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gse1Q3U3C9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gse1Q3U3C9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gse1Q3U3C9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gse1Q3U3C9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gse1Q3U3C9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gse1Q3U3C9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gse1Q3U3C9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gse1Q3U3C9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gse1Q3U3C9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gse1Q3U3C9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gse1Q3U3C9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gse1Q3U3C9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gse1Q3U3C9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gse1Q3U3C9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gse1Q3U3C9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gse1Q3U3C9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms