Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 CHD6-205ENST00000440697 1635 ntTSL 57.94□□□□□ -1.143e-7■■■■■ 30.5
PUM1Q14671 CHD6-201ENST00000309279 1635 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.143e-7■■■■■ 30.5
PUM1Q14671 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.413e-7■■■■■ 30.5
PUM1Q14671 PDS5B-207ENST00000482955 581 ntTSL 322.49■■□□□ 1.192e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 CCDC25-202ENST00000517979 877 ntTSL 1 (best)14.3□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 COX17-202ENST00000468918 555 ntTSL 414.17□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 PDS5B-208ENST00000493653 972 ntTSL 1 (best)12.6□□□□□ -0.392e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 COX17-201ENST00000261070 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 COX17-205ENST00000490145 513 ntTSL 512.28□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 EIF3K-209ENST00000590134 711 ntTSL 210.04□□□□□ -0.82e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 COX17-203ENST00000484810 471 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.822e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 LARP7-201ENST00000324052 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.872e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 TFDP2-209ENST00000477292 1403 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 TFDP2-222ENST00000495310 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 SH3BGRL-202ENST00000463546 755 ntTSL 28.87□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 LARP7-208ENST00000507443 753 ntTSL 58.55□□□□□ -1.042e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 TFDP2-224ENST00000499676 9335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 SH3BGRL-204ENST00000481106 928 ntTSL 1 (best)8.37□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 SH3BGRL-203ENST00000474113 739 ntTSL 38.18□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 LARP7-207ENST00000505216 477 ntTSL 38.01□□□□□ -1.132e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 LARP7-214ENST00000512589 556 ntTSL 47.69□□□□□ -1.182e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 TFDP2-213ENST00000487734 1469 ntTSL 57.62□□□□□ -1.192e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.242e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 TFDP2-212ENST00000486111 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.282e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 COX17-204ENST00000486606 430 ntTSL 36.93□□□□□ -1.32e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 LARP7-209ENST00000508577 579 ntTSL 46.88□□□□□ -1.312e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 CCDC25-203ENST00000519299 581 ntTSL 26.88□□□□□ -1.312e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 NCKAP1-204ENST00000477988 612 ntTSL 26.8□□□□□ -1.322e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 COX17-207ENST00000497997 565 ntTSL 26.4□□□□□ -1.382e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 LARP7-206ENST00000505034 1047 ntTSL 26.26□□□□□ -1.412e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.412e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 LARP7-215ENST00000513553 528 ntTSL 36.01□□□□□ -1.452e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.462e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 LARP7-211ENST00000509622 2020 ntTSL 1 (best)5.96□□□□□ -1.462e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 CCDC25-205ENST00000519843 481 ntTSL 25.17□□□□□ -1.582e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.592e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 PDS5B-204ENST00000466078 1889 ntTSL 24.22□□□□□ -1.732e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 PDS5B-209ENST00000498550 4238 ntTSL 1 (best)3.51□□□□□ -1.852e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 PDS5B-203ENST00000450460 5246 ntTSL 1 (best)3.47□□□□□ -1.852e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 DRAP1-203ENST00000525190 474 nt23.69■■□□□ 1.388e-11■■■■■ 30.3
PUM1Q14671 EBNA1BP2-202ENST00000431635 1503 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.593e-20■■■■■ 30.1
PUM1Q14671 EBNA1BP2-201ENST00000236051 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.873e-20■■■■■ 30.1
PUM1Q14671 EBNA1BP2-204ENST00000463906 937 ntTSL 26.32□□□□□ -1.43e-20■■■■■ 30.1
PUM1Q14671 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 30.1
PUM1Q14671 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 30.1
PUM1Q14671 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.472e-7■■■■■ 30.1
PUM1Q14671 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.673e-7■■■■■ 29.9
PUM1Q14671 WBP2-205ENST00000586257 676 ntTSL 318.69■□□□□ 0.583e-7■■■■■ 29.9
PUM1Q14671 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.533e-7■■■■■ 29.9
PUM1Q14671 WBP2-208ENST00000588373 1374 ntTSL 217.73■□□□□ 0.433e-7■■■■■ 29.9
PUM1Q14671 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 29.9
PUM1Q14671 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.173e-7■■■■■ 29.9
PUM1Q14671 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 29.9
PUM1Q14671 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 29.9
PUM1Q14671 WBP2-209ENST00000589236 747 ntTSL 213.31□□□□□ -0.283e-7■■■■■ 29.9
PUM1Q14671 WBP2-216ENST00000591831 1406 ntTSL 512.93□□□□□ -0.343e-7■■■■■ 29.9
PUM1Q14671 WBP2-207ENST00000587642 3718 ntTSL 28.76□□□□□ -1.013e-7■■■■■ 29.9
PUM1Q14671 MAPK12-202ENST00000395778 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.483e-7■■■■■ 29.8
PUM1Q14671 SLC38A2-208ENST00000549258 4384 ntTSL 23.98□□□□□ -1.775e-9■■■■■ 29.3
PUM1Q14671 AXIN1-205ENST00000481769 1089 ntTSL 328.83■■■□□ 2.213e-13■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 BOP1-204ENST00000569403 651 ntTSL 427.16■■□□□ 1.941e-6■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.714e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 ABCA2-211ENST00000464520 886 ntTSL 225.51■■□□□ 1.674e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.594e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 MLST8-226ENST00000566835 1565 ntTSL 224.37■■□□□ 1.494e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.414e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 MLST8-230ENST00000568194 2116 ntTSL 1 (best)22.63■■□□□ 1.214e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 SREBF1-208ENST00000469356 1323 ntTSL 322.34■■□□□ 1.174e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 SREBF1-210ENST00000471445 936 ntTSL 221.95■■□□□ 1.14e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.021e-6■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 MLST8-208ENST00000562392 1662 ntTSL 220.86■□□□□ 0.934e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.784e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.674e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.674e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 MLST8-212ENST00000563067 1646 ntTSL 519.05■□□□□ 0.644e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 ABCA2-217ENST00000479446 6295 ntTSL 1 (best)19.05■□□□□ 0.644e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.534e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.464e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 SPOUT1-202ENST00000466556 926 ntTSL 317.52■□□□□ 0.44e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 MLST8-221ENST00000565330 1403 ntTSL 217.16■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.324e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.264e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 MLST8-231ENST00000568542 1865 ntTSL 1 (best)16.69■□□□□ 0.264e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.244e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 ABCA2-220ENST00000490486 666 ntTSL 216.16■□□□□ 0.184e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.134e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 ARHGEF1-222ENST00000600517 428 ntTSL 313.81□□□□□ -0.24e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 HDAC1-203ENST00000463172 895 ntTSL 213.66□□□□□ -0.224e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.234e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.234e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 HDAC1-207ENST00000481281 721 ntTSL 513.42□□□□□ -0.264e-7■■■■■ 29.1
Retrieved 100 of 12,080 protein–RNA pairs in 38.2 ms