Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rtel1Q0VGM9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rtel1Q0VGM9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rtel1Q0VGM9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rtel1Q0VGM9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rtel1Q0VGM9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rtel1Q0VGM9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rtel1Q0VGM9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rtel1Q0VGM9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rtel1Q0VGM9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Rtel1Q0VGM9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rtel1Q0VGM9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rtel1Q0VGM9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rtel1Q0VGM9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtel1Q0VGM9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtel1Q0VGM9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtel1Q0VGM9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rtel1Q0VGM9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rtel1Q0VGM9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rtel1Q0VGM9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rtel1Q0VGM9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rtel1Q0VGM9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rtel1Q0VGM9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rtel1Q0VGM9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rtel1Q0VGM9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rtel1Q0VGM9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rtel1Q0VGM9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rtel1Q0VGM9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rtel1Q0VGM9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rtel1Q0VGM9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rtel1Q0VGM9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rtel1Q0VGM9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rtel1Q0VGM9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rtel1Q0VGM9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rtel1Q0VGM9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rtel1Q0VGM9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Rtel1Q0VGM9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rtel1Q0VGM9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rtel1Q0VGM9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rtel1Q0VGM9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rtel1Q0VGM9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtel1Q0VGM9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtel1Q0VGM9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtel1Q0VGM9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rtel1Q0VGM9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rtel1Q0VGM9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Rtel1Q0VGM9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rtel1Q0VGM9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rtel1Q0VGM9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rtel1Q0VGM9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rtel1Q0VGM9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rtel1Q0VGM9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rtel1Q0VGM9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rtel1Q0VGM9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rtel1Q0VGM9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rtel1Q0VGM9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Rtel1Q0VGM9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rtel1Q0VGM9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rtel1Q0VGM9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rtel1Q0VGM9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rtel1Q0VGM9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtel1Q0VGM9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtel1Q0VGM9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rtel1Q0VGM9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rtel1Q0VGM9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Rtel1Q0VGM9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rtel1Q0VGM9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Rtel1Q0VGM9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Rtel1Q0VGM9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rtel1Q0VGM9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rtel1Q0VGM9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rtel1Q0VGM9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rtel1Q0VGM9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Rtel1Q0VGM9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rtel1Q0VGM9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rtel1Q0VGM9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rtel1Q0VGM9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rtel1Q0VGM9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rtel1Q0VGM9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rtel1Q0VGM9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rtel1Q0VGM9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rtel1Q0VGM9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rtel1Q0VGM9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtel1Q0VGM9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtel1Q0VGM9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rtel1Q0VGM9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rtel1Q0VGM9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rtel1Q0VGM9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtel1Q0VGM9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtel1Q0VGM9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtel1Q0VGM9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rtel1Q0VGM9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rtel1Q0VGM9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rtel1Q0VGM9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rtel1Q0VGM9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Rtel1Q0VGM9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rtel1Q0VGM9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rtel1Q0VGM9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rtel1Q0VGM9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rtel1Q0VGM9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms