Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
Vps8Q0P5W1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Vps8Q0P5W1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Vps8Q0P5W1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Vps8Q0P5W1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Vps8Q0P5W1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Vps8Q0P5W1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
Vps8Q0P5W1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
Vps8Q0P5W1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Vps8Q0P5W1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Vps8Q0P5W1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
Vps8Q0P5W1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC39.45■■■■□ 3.91
Vps8Q0P5W1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Vps8Q0P5W1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Vps8Q0P5W1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Vps8Q0P5W1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Vps8Q0P5W1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Vps8Q0P5W1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Vps8Q0P5W1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Vps8Q0P5W1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Vps8Q0P5W1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Vps8Q0P5W1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Vps8Q0P5W1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Vps8Q0P5W1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Vps8Q0P5W1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Vps8Q0P5W1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Vps8Q0P5W1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Vps8Q0P5W1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Vps8Q0P5W1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Vps8Q0P5W1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Vps8Q0P5W1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Vps8Q0P5W1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Vps8Q0P5W1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Vps8Q0P5W1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
Vps8Q0P5W1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Vps8Q0P5W1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Vps8Q0P5W1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Vps8Q0P5W1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Vps8Q0P5W1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Vps8Q0P5W1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Vps8Q0P5W1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Vps8Q0P5W1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Vps8Q0P5W1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Vps8Q0P5W1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Vps8Q0P5W1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Vps8Q0P5W1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Vps8Q0P5W1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Vps8Q0P5W1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
Vps8Q0P5W1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Vps8Q0P5W1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Vps8Q0P5W1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Vps8Q0P5W1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
Vps8Q0P5W1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Vps8Q0P5W1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Vps8Q0P5W1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Vps8Q0P5W1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Vps8Q0P5W1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Vps8Q0P5W1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Vps8Q0P5W1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Vps8Q0P5W1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Vps8Q0P5W1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Vps8Q0P5W1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Vps8Q0P5W1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
Vps8Q0P5W1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Vps8Q0P5W1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Vps8Q0P5W1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
Vps8Q0P5W1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Vps8Q0P5W1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Vps8Q0P5W1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Vps8Q0P5W1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Vps8Q0P5W1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Vps8Q0P5W1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Vps8Q0P5W1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
Vps8Q0P5W1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Vps8Q0P5W1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Vps8Q0P5W1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Vps8Q0P5W1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Vps8Q0P5W1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Vps8Q0P5W1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Vps8Q0P5W1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC38.57■■■■□ 3.77
Vps8Q0P5W1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Vps8Q0P5W1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Vps8Q0P5W1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Vps8Q0P5W1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Vps8Q0P5W1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Vps8Q0P5W1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Vps8Q0P5W1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Vps8Q0P5W1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Vps8Q0P5W1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Vps8Q0P5W1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Vps8Q0P5W1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Vps8Q0P5W1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Vps8Q0P5W1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Vps8Q0P5W1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Vps8Q0P5W1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Vps8Q0P5W1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Vps8Q0P5W1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Vps8Q0P5W1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Vps8Q0P5W1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Vps8Q0P5W1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.2 ms