Protein–RNA interactions for Protein: Q08048

Hgf, Hepatocyte growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HgfQ08048 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HgfQ08048 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HgfQ08048 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HgfQ08048 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HgfQ08048 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HgfQ08048 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HgfQ08048 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HgfQ08048 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HgfQ08048 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HgfQ08048 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HgfQ08048 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HgfQ08048 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HgfQ08048 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HgfQ08048 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HgfQ08048 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HgfQ08048 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HgfQ08048 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HgfQ08048 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HgfQ08048 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HgfQ08048 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HgfQ08048 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HgfQ08048 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HgfQ08048 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HgfQ08048 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HgfQ08048 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HgfQ08048 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HgfQ08048 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HgfQ08048 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HgfQ08048 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HgfQ08048 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HgfQ08048 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HgfQ08048 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HgfQ08048 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HgfQ08048 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HgfQ08048 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HgfQ08048 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HgfQ08048 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HgfQ08048 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HgfQ08048 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HgfQ08048 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HgfQ08048 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HgfQ08048 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HgfQ08048 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HgfQ08048 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HgfQ08048 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HgfQ08048 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HgfQ08048 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HgfQ08048 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HgfQ08048 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HgfQ08048 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HgfQ08048 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HgfQ08048 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HgfQ08048 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HgfQ08048 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HgfQ08048 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HgfQ08048 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HgfQ08048 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HgfQ08048 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HgfQ08048 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HgfQ08048 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HgfQ08048 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HgfQ08048 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HgfQ08048 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HgfQ08048 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HgfQ08048 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HgfQ08048 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HgfQ08048 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HgfQ08048 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HgfQ08048 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HgfQ08048 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HgfQ08048 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HgfQ08048 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HgfQ08048 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HgfQ08048 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HgfQ08048 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HgfQ08048 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HgfQ08048 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HgfQ08048 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HgfQ08048 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HgfQ08048 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HgfQ08048 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HgfQ08048 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HgfQ08048 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HgfQ08048 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HgfQ08048 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HgfQ08048 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HgfQ08048 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HgfQ08048 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HgfQ08048 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HgfQ08048 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HgfQ08048 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HgfQ08048 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HgfQ08048 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HgfQ08048 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HgfQ08048 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HgfQ08048 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HgfQ08048 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HgfQ08048 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HgfQ08048 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HgfQ08048 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms