Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah2Q06986 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah2Q06986 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Siah2Q06986 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Siah2Q06986 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Siah2Q06986 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Siah2Q06986 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Siah2Q06986 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Siah2Q06986 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Siah2Q06986 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Siah2Q06986 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Siah2Q06986 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Siah2Q06986 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Siah2Q06986 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Siah2Q06986 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Siah2Q06986 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah2Q06986 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah2Q06986 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah2Q06986 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah2Q06986 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah2Q06986 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah2Q06986 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah2Q06986 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah2Q06986 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah2Q06986 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Siah2Q06986 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Siah2Q06986 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Siah2Q06986 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Siah2Q06986 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Siah2Q06986 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Siah2Q06986 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah2Q06986 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah2Q06986 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Siah2Q06986 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Siah2Q06986 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Siah2Q06986 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Siah2Q06986 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Siah2Q06986 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Siah2Q06986 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Siah2Q06986 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Siah2Q06986 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Siah2Q06986 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Siah2Q06986 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Siah2Q06986 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Siah2Q06986 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah2Q06986 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah2Q06986 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah2Q06986 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah2Q06986 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah2Q06986 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah2Q06986 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Siah2Q06986 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Siah2Q06986 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Siah2Q06986 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Siah2Q06986 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Siah2Q06986 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Siah2Q06986 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah2Q06986 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Siah2Q06986 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Siah2Q06986 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Siah2Q06986 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah2Q06986 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah2Q06986 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah2Q06986 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah2Q06986 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah2Q06986 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah2Q06986 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah2Q06986 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah2Q06986 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah2Q06986 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Siah2Q06986 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah2Q06986 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah2Q06986 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah2Q06986 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah2Q06986 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah2Q06986 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah2Q06986 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah2Q06986 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah2Q06986 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah2Q06986 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah2Q06986 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah2Q06986 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah2Q06986 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah2Q06986 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Siah2Q06986 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Siah2Q06986 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Siah2Q06986 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Siah2Q06986 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Siah2Q06986 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Siah2Q06986 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Siah2Q06986 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Siah2Q06986 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Siah2Q06986 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Siah2Q06986 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Siah2Q06986 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Siah2Q06986 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Siah2Q06986 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Siah2Q06986 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Siah2Q06986 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Siah2Q06986 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms