Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21,07■□□□□ 0,96
Siah2Q06986 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Siah2Q06986 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,03■□□□□ 0,96
Siah2Q06986 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Siah2Q06986 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Siah2Q06986 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Siah2Q06986 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Siah2Q06986 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Siah2Q06986 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20,99■□□□□ 0,95
Siah2Q06986 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Siah2Q06986 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Siah2Q06986 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20,95■□□□□ 0,94
Siah2Q06986 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Siah2Q06986 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20,94■□□□□ 0,94
Siah2Q06986 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,94■□□□□ 0,94
Siah2Q06986 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Siah2Q06986 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Siah2Q06986 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Siah2Q06986 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Siah2Q06986 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Siah2Q06986 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Siah2Q06986 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20,9■□□□□ 0,94
Siah2Q06986 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Siah2Q06986 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Siah2Q06986 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Siah2Q06986 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20,89■□□□□ 0,93
Siah2Q06986 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20,89■□□□□ 0,93
Siah2Q06986 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20,87■□□□□ 0,93
Siah2Q06986 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Siah2Q06986 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Siah2Q06986 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Siah2Q06986 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Siah2Q06986 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Siah2Q06986 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Siah2Q06986 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Siah2Q06986 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Siah2Q06986 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Siah2Q06986 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Siah2Q06986 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Siah2Q06986 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Siah2Q06986 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Siah2Q06986 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Siah2Q06986 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20,77■□□□□ 0,92
Siah2Q06986 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Siah2Q06986 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Siah2Q06986 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Siah2Q06986 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Siah2Q06986 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Siah2Q06986 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Siah2Q06986 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Siah2Q06986 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Siah2Q06986 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20,71■□□□□ 0,91
Siah2Q06986 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,91
Siah2Q06986 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Siah2Q06986 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Siah2Q06986 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Siah2Q06986 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Siah2Q06986 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Siah2Q06986 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20,66■□□□□ 0,9
Siah2Q06986 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Siah2Q06986 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Siah2Q06986 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20,64■□□□□ 0,89
Siah2Q06986 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20,64■□□□□ 0,89
Siah2Q06986 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Siah2Q06986 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Siah2Q06986 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20,62■□□□□ 0,89
Siah2Q06986 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20,61■□□□□ 0,89
Siah2Q06986 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Siah2Q06986 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20,6■□□□□ 0,89
Siah2Q06986 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20,59■□□□□ 0,89
Siah2Q06986 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,58■□□□□ 0,89
Siah2Q06986 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20,58■□□□□ 0,89
Siah2Q06986 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Siah2Q06986 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Siah2Q06986 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Siah2Q06986 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Siah2Q06986 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Siah2Q06986 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Siah2Q06986 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Siah2Q06986 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,51■□□□□ 0,87
Siah2Q06986 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20,5■□□□□ 0,87
Siah2Q06986 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Siah2Q06986 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Siah2Q06986 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20,49■□□□□ 0,87
Siah2Q06986 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Siah2Q06986 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20,49■□□□□ 0,87
Siah2Q06986 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Siah2Q06986 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Siah2Q06986 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Siah2Q06986 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Siah2Q06986 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Siah2Q06986 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Siah2Q06986 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20,43■□□□□ 0,86
Siah2Q06986 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Siah2Q06986 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Siah2Q06986 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20,4■□□□□ 0,86
Siah2Q06986 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
Siah2Q06986 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20,39■□□□□ 0,86
Siah2Q06986 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
Siah2Q06986 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20,38■□□□□ 0,85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms