Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cab39Q06138 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cab39Q06138 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cab39Q06138 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cab39Q06138 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cab39Q06138 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cab39Q06138 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cab39Q06138 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cab39Q06138 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cab39Q06138 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cab39Q06138 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cab39Q06138 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cab39Q06138 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cab39Q06138 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cab39Q06138 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cab39Q06138 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cab39Q06138 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cab39Q06138 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cab39Q06138 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cab39Q06138 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cab39Q06138 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cab39Q06138 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cab39Q06138 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cab39Q06138 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cab39Q06138 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cab39Q06138 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cab39Q06138 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cab39Q06138 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cab39Q06138 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cab39Q06138 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cab39Q06138 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cab39Q06138 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cab39Q06138 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cab39Q06138 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cab39Q06138 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cab39Q06138 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cab39Q06138 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cab39Q06138 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cab39Q06138 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cab39Q06138 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cab39Q06138 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cab39Q06138 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cab39Q06138 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cab39Q06138 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cab39Q06138 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cab39Q06138 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cab39Q06138 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cab39Q06138 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cab39Q06138 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cab39Q06138 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cab39Q06138 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cab39Q06138 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cab39Q06138 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cab39Q06138 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cab39Q06138 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cab39Q06138 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cab39Q06138 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cab39Q06138 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cab39Q06138 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cab39Q06138 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cab39Q06138 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cab39Q06138 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cab39Q06138 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cab39Q06138 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cab39Q06138 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cab39Q06138 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cab39Q06138 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cab39Q06138 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cab39Q06138 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cab39Q06138 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cab39Q06138 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cab39Q06138 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cab39Q06138 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cab39Q06138 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cab39Q06138 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cab39Q06138 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cab39Q06138 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cab39Q06138 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cab39Q06138 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cab39Q06138 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cab39Q06138 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cab39Q06138 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cab39Q06138 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cab39Q06138 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cab39Q06138 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cab39Q06138 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cab39Q06138 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cab39Q06138 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cab39Q06138 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cab39Q06138 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cab39Q06138 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cab39Q06138 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cab39Q06138 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cab39Q06138 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cab39Q06138 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cab39Q06138 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cab39Q06138 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cab39Q06138 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cab39Q06138 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cab39Q06138 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms