Protein–RNA interactions for Protein: Q05CL8

Larp7, La-related protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp7Q05CL8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Larp7Q05CL8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Larp7Q05CL8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Larp7Q05CL8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Larp7Q05CL8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Larp7Q05CL8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Larp7Q05CL8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Larp7Q05CL8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Larp7Q05CL8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Larp7Q05CL8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Larp7Q05CL8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Larp7Q05CL8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Larp7Q05CL8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Larp7Q05CL8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Larp7Q05CL8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Larp7Q05CL8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Larp7Q05CL8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Larp7Q05CL8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Larp7Q05CL8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Larp7Q05CL8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Larp7Q05CL8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Larp7Q05CL8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Larp7Q05CL8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Larp7Q05CL8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Larp7Q05CL8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Larp7Q05CL8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Larp7Q05CL8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Larp7Q05CL8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Larp7Q05CL8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Larp7Q05CL8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Larp7Q05CL8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Larp7Q05CL8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Larp7Q05CL8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Larp7Q05CL8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Larp7Q05CL8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Larp7Q05CL8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Larp7Q05CL8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Larp7Q05CL8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Larp7Q05CL8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Larp7Q05CL8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Larp7Q05CL8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Larp7Q05CL8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Larp7Q05CL8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Larp7Q05CL8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Larp7Q05CL8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Larp7Q05CL8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Larp7Q05CL8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Larp7Q05CL8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Larp7Q05CL8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Larp7Q05CL8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Larp7Q05CL8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Larp7Q05CL8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Larp7Q05CL8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Larp7Q05CL8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Larp7Q05CL8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Larp7Q05CL8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Larp7Q05CL8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Larp7Q05CL8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Larp7Q05CL8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Larp7Q05CL8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Larp7Q05CL8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Larp7Q05CL8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Larp7Q05CL8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Larp7Q05CL8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Larp7Q05CL8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Larp7Q05CL8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Larp7Q05CL8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Larp7Q05CL8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Larp7Q05CL8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Larp7Q05CL8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Larp7Q05CL8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Larp7Q05CL8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Larp7Q05CL8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Larp7Q05CL8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Larp7Q05CL8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Larp7Q05CL8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Larp7Q05CL8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Larp7Q05CL8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Larp7Q05CL8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Larp7Q05CL8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Larp7Q05CL8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Larp7Q05CL8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Larp7Q05CL8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Larp7Q05CL8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Larp7Q05CL8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Larp7Q05CL8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Larp7Q05CL8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Larp7Q05CL8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Larp7Q05CL8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Larp7Q05CL8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Larp7Q05CL8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Larp7Q05CL8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Larp7Q05CL8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Larp7Q05CL8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Larp7Q05CL8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Larp7Q05CL8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Larp7Q05CL8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Larp7Q05CL8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Larp7Q05CL8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Larp7Q05CL8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms