Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Crisp3Q03402 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Crisp3Q03402 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Crisp3Q03402 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Crisp3Q03402 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Crisp3Q03402 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Crisp3Q03402 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Crisp3Q03402 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Crisp3Q03402 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Crisp3Q03402 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Crisp3Q03402 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Crisp3Q03402 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Crisp3Q03402 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Crisp3Q03402 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Crisp3Q03402 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Crisp3Q03402 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Crisp3Q03402 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Crisp3Q03402 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Crisp3Q03402 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Crisp3Q03402 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Crisp3Q03402 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Crisp3Q03402 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Crisp3Q03402 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Crisp3Q03402 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Crisp3Q03402 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Crisp3Q03402 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Crisp3Q03402 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Crisp3Q03402 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Crisp3Q03402 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Crisp3Q03402 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Crisp3Q03402 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Crisp3Q03402 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Crisp3Q03402 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Crisp3Q03402 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Crisp3Q03402 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Crisp3Q03402 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Crisp3Q03402 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Crisp3Q03402 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Crisp3Q03402 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Crisp3Q03402 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Crisp3Q03402 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Crisp3Q03402 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Crisp3Q03402 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Crisp3Q03402 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Crisp3Q03402 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Crisp3Q03402 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Crisp3Q03402 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Crisp3Q03402 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Crisp3Q03402 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Crisp3Q03402 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Crisp3Q03402 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Crisp3Q03402 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Crisp3Q03402 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Crisp3Q03402 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Crisp3Q03402 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Crisp3Q03402 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Crisp3Q03402 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Crisp3Q03402 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Crisp3Q03402 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Crisp3Q03402 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Crisp3Q03402 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Crisp3Q03402 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Crisp3Q03402 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Crisp3Q03402 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Crisp3Q03402 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Crisp3Q03402 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Crisp3Q03402 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Crisp3Q03402 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Crisp3Q03402 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Crisp3Q03402 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Crisp3Q03402 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Crisp3Q03402 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Crisp3Q03402 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Crisp3Q03402 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Crisp3Q03402 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Crisp3Q03402 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Crisp3Q03402 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Crisp3Q03402 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Crisp3Q03402 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Crisp3Q03402 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Crisp3Q03402 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Crisp3Q03402 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Crisp3Q03402 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Crisp3Q03402 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Crisp3Q03402 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Crisp3Q03402 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Crisp3Q03402 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Crisp3Q03402 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Crisp3Q03402 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Crisp3Q03402 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Crisp3Q03402 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Crisp3Q03402 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Crisp3Q03402 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Crisp3Q03402 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Crisp3Q03402 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Crisp3Q03402 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Crisp3Q03402 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Crisp3Q03402 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Crisp3Q03402 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Crisp3Q03402 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms